Різниця між агарозою та поліакриламідом

Агароза проти поліакриламіду
 

Агароза та Поліакриламід - це водорозчинні полімери, але між ними можна помітити багато відмінностей, починаючи з їх походження. І Агароза, і Поліакриламід мають щось спільне в їх здатності утворювати пористі гелеві матриці. Незважаючи на це, існує ряд чітких відмінностей між ними. Основні відмінності між обома цими полімерами полягають у їхньому характері походження, хімічній структурі, різному застосуванні та їх ефективності щодо гель-електрофорезу.

Що таке агароза?

Агароза є природний лінійний полімер, який, в свою чергу, походить від складного полімеру під назвою агар, знайденого в водоростях. Агароза витягується з агару шляхом видалення її білкового компонента, званого агаропектин. Агароза - це те, що дає агару його здатність утворювати гелі.

Основне застосування агарози - в мікробіологічних та молекулярно-біологічних дослідженнях. У мікробіологічних дослідженнях агароза при доповненні відповідними поживними речовинами забезпечує міцну основу для культивування мікроорганізмів, таких як бактерії та грибки. При використанні в напівтвердих концентраціях це може бути корисно при оцінці рухливості цих мікроорганізмів. У молекулярній біології він служить важливим інструментом для одного з найбільш фундаментальних процесів роздільної здатності, який називається "гель-електрофорез'або'електрофорез агарозного гелю'(ВІК). Гель-електрофорез - це процес, який дозволяє розділити або розділити нуклеїнові кислоти або білок залежно від їх розміру та заряду. Тут агароза служить пористим ситоподібним гелем, через який відбувається поділ.

Структура агарози

Що таке поліакриламід?

Поліакриламід є синтетичний полімер і застосовується в найрізноманітніших галузях промисловості. Як було сказано раніше, його використання покладається на його здатність утворювати гелі. Однак, крім цього, його здатність утримувати та зливати воду в різних концентраціях також використовується в різних галузях промисловості.

Найпоширеніший і Поширене використання поліакриламіду в очищенні стічних вод. Тут він використовується як флокулюючий засіб для видалення будь-якого суспендованого органічного матеріалу; отже, поліпшення помутніння та очищення води. Ще одне використання поліакриламіду - у паперовій промисловості. Тут він використовується для утримання або зливання води з паперової маси, якщо потрібно. Так само в сільськогосподарській та будівельній галузях використовується як кондиціонер для запобігання ерозії ґрунту та поліпшення його якості.

Як і агароза, поліакриламід також використовується в молекулярній біології як важливий інструмент роздільної здатності в аналогічному процесі, який називається "Електрофорез поліакриламідного гелю (PAGE). На додаток до всього цього, поліакриламід також використовується при переробці руди та виробництві флокуляційного агента для видалення будь-якого суспендованого органічного матеріалу; отже, поліпшення помутніння та очищення води. Ще одне використання поліакриламіду - у паперовій промисловості. Тут він використовується для утримання або зливання води з паперової маси, якщо потрібно. Так само в сільськогосподарській та будівельній галузях використовується як кондиціонер для запобігання ерозії ґрунту та поліпшення його якості. На додаток до всього цього, поліакриламід використовується також у виробництві харчових добавок, м'яких контактних лінз та текстилю.

Структура поліакриламіду

Яка різниця між агарозою та поліакриламідом?

Походження агарози та поліакриламіду:

Агароза: Агароза - полімер природного походження. Він отримується з водоростей.

Поліакриламід: Поліакриламід синтетичного походження і не зустрічається ні за яких природних обставин.

Молекулярна формула агарози та поліакриламіду:

Агароза: Молекулярна формула агарози - С₂₄Н₃₈О₁₉.

Поліакриламід: Молекулярна формула поліакриламіду - (С ₃Н₅НІ)_н.

Хімічна структура агарози та поліакриламіду:

Агароза: Агароза - лінійний полісахарид. Він складається з повторюваних дисахаридних одиниць, званих агробіоза, утримуваних разом водневими зв’язками.

Поліакриламід: Поліакриламід - хімічно зшитий полімер. Він складається з мономерів акриламіду та зшиваючого агента N, N'-метиленбісакриламіду.

Токсичність агарози та поліакриламіду:

Агароза: Як агароза, так і її мономерна агробіоза мають нетоксичний характер.

Поліакриламід: Мономерна одиниця поліакриламіду, акриламіду, є імовірним канцерогеном і відомим нейротоксином, хоча його полімеризована форма нетоксична за своєю природою.

Характеристики гелів агарози та поліакриламіду:

ВІК та СТОРІНКА:

Агароза: Приготування агарозного гелю для AGE менш трудомістка, проста і проста, і не потребує ініціатора або полімеризуючого каталізатора.

Поліакриламід: Приготування поліакриламідного гелю для PAGE є трудомістким і стомлюючим, а також потребує ініціатора (персульфат амонію) та каталізатора полімеризації (N, N, N ', N'-тетраметилетилендіамін - TEMED).

Природа:

Поліакриламідні гелі хімічно стійкіші, ніж гелі агарози.

Розмір пори:

Враховуючи ту ж концентрацію, матриці поліакриламідного гелю мають тенденцію до менших розмірів пор порівняно з матрицею гелю агарози.

Зміна розміру пори:

Розмір пор поліакриламідних гелів може бути змінений більш контрольованим чином, ніж розмір агарозних гелів.

Роздільна потужність:

Поліакриламідні гелі мають високу роздільну здатність, а агарозні гелі мають низьку роздільну здатність.

Приміщення нуклеїнової кислоти:

Поліакриламідні гелі можуть вміщувати більшу кількість нуклеїнової кислоти, ніж агарозні гелі для розсмоктування.

Зображення надано: агароза та структура поліакриламіду за допомогою Wikicommons (Public Domain)