Різниця між кДНК та геномною бібліотекою

Ключова різниця - кДНК проти геномної бібліотеки
 

Існують два основних типи бібліотек ДНК, побудовані вченими з використанням методів генної інженерії. Це бібліотека кДНК та геномна бібліотека. The ключова різниця між кДНК і геномною бібліотекою це те, що кДНК-бібліотека містить клоновану комплементарну ДНК загальної мРНК організму, тоді як бібліотека геномної ДНК містить клоновані фрагменти всього геному організму. Геномна бібліотека ДНК більша, ніж бібліотека кДНК.

ЗМІСТ
1. Огляд та ключові відмінності
2. Що таке бібліотека кДНК
3. Що таке Геномна бібліотека
4. Поплечне порівняння - кДНК та геномна бібліотека
5. Підсумок

Що таке геномна бібліотека?

Геномна бібліотека ДНК - це сукупність клонів, що містять фрагменти загальної геномної ДНК організму. Він містить всю геномну ДНК цього організму, включаючи кодуючі та некодуючі послідовності. Побудова геномної бібліотеки виконується за допомогою технології рекомбінантних ДНК з подальшим клонуванням (генна інженерія). У конструюванні беруть участь різні етапи, як показано на малюнку 01. Процес починається з виділення геномної ДНК. Використовуючи відповідний протокол вилучення ДНК, слід виділити загальну геномну ДНК організму. Потім ДНК слід перетворити на керовані розміри або в конкретні фрагменти за допомогою рестрикційних ендонуклеаз (ДНК-різальних ферментів). Фрагментовану ДНК слід вводити у вектори за допомогою ДНК-лігаз (ДНК, що приєднується до ферментів). Вектор - організм, що самовідтворюється. Плазміди та бактеріофаги зазвичай використовуються векторами в технології рекомбінантних ДНК. Ці зв’язані вектори відомі як молекули рекомбінантної ДНК, оскільки вони несуть як власні, так і вставлені послідовності ДНК. Рекомбінантні вектори додають до бактерії-господаря і роблять для поглинання рекомбінантних векторів всередині бактеріальної клітини. Бактерії з рекомбінантними векторами (плазмідами) слід вирощувати в культуральному середовищі. Під час розмноження бактерій бактеріальна ДНК разом з рекомбінантними плазмідами копіює свої геноми і утворює клони. Ці клони містять весь геном організму-джерела. Отже, її називають геномною бібліотекою. Плазміди легко відокремити від бактеріальної хромосомної ДНК для побудови геномної бібліотеки цього організму. Якщо певний організм містить зацікавлені гени, його легко виявити в геномній бібліотеці шляхом гібридизації за допомогою молекулярних зондів (маркерів).

Геномні бібліотеки важливі для вивчення геномної структури та функції, конкретних генів, розташування генів, картографування генів, мутацій, послідовності генів, ідентифікації нових терапевтичних генів тощо.

Рисунок_1: Побудова геномної бібліотеки

Що таке бібліотека кДНК?

Бібліотека кДНК - це сукупність клонів комплементарної ДНК (кДНК), синтезованих із загальної мРНК організму. Процедура будівництва передбачає різні етапи. Очищення загальної мРНК від організму є першим етапом. Ізольована мРНК перетворюється в нитки кДНК за допомогою процесу, званого зворотною транскрипцією. Зворотна транскрипція сприяє ферменту, званому зворотною транскриптазою. Він використовує невеликий 3 'праймер і ініціює синтез першої нитки кДНК, комплементарної до ланцюга мРНК шаблону. Отриману в результаті дволанцюжкову кДНК перетворюють на більш дрібні фрагменти за допомогою рестрикційних ендонуклеаз і вставляють у відповідні вектори. Ці сконструйовані рекомбінантні молекули потім додаються в організм господаря і вирощуються в культуральному середовищі для отримання клонів. Колекція клонів, що містять фрагменти кДНК організму, відома як бібліотека кДНК. Повністю нарізана зріла мРНК не містить інтронів та регуляторних областей. Тому фрагменти, що не кодують, відсутні в бібліотеках кДНК на відміну від геномної бібліотеки.

бібліотеки кДНК важливі для аналізу кодуючих областей, функцій генів, експресії генів тощо.

Рисунок_2: Побудова бібліотеки кДНК

Яка різниця між кДНК та геномною бібліотекою?

кДНК проти геномної бібліотеки
кДНК бібліотека - це сукупність клонів, що несуть комплементарну ДНК до мРНК організму	Геномна бібліотека - це сукупність клонів, що несуть загальну геномну ДНК організму.
Послідовності кодування проти некодування
кДНК бібліотека містить тільки кодуючі послідовності; він не містить інтронів.	Геномна бібліотека складається з усієї геномної ДНК, включаючи некодуючу (інтрони і регуляторну) ДНК.
Розмір
бібліотека кДНК невелика.	Геномна бібліотека велика.
Вихідний матеріал
Вихідним матеріалом є мРНК	Вихідним матеріалом є ДНК.
Залучення зворотної транскрипції.
Зворотна транскрипція відбувається при синтезі першого ланцюга кДНК.	Зворотної транскрипції не відбувається.

Підсумок - кДНК та геномна бібліотека

Геномна бібліотека являє собою популяцію клонів, що несуть фрагментовану загальну геномну ДНК організму. кДНК бібліотека представляє популяцію клонів, що несуть комплементарну ДНК загальної мРНК організму. Клон кДНК містить тільки послідовності, знайдені в мРНК, тоді як геномний клон містить послідовності всього геному. Це різниця між кДНК і геномною бібліотекою.

Довідка:
1. Ханейф, Діна Т КочунніДжазір. "Різниця між бібліотекою Genomic та кДНК." Різниця між бібліотекою Genomic та кДНК. Н.п., н.д. Веб. 15 лютого 2017 року
2. Штекель, Дов Дж., Йоав Гіт та Франческо Фальсіані. "Порівняння експресії генів з декількох бібліотек кДНК". Дослідження геному. Лабораторна преса «Холодна весна», грудень 2000. Веб. 16 лютого 2017 року
3. "Геномні бібліотечні екрани для генів, залучених до толерантності n-бутанолу в паличці Escherichia." Екрани геномної бібліотеки для генів, залучених до толерантності n-бутанолу в паличці Escherichia. Н.п., н.д. Веб. 16 лютого 2017 року

Надано зображення:
1. "Формування бібліотеки кДНК" доктора наук з англійської мови Вікіпедія (CC BY-SA 3.0) через Вікісховище
2. "Геномна побудова бібліотеки" від Aluquette - Власна робота (CC BY-SA 3.0) через Wikimedia Commons