Різниця між клоном шляхом секвенування клонів та секвенування дробовика

The ключова різниця між клонуванням шляхом клонування секвенуванням і секвенуванням рушниці полягає в їх способі проведення. Клон методом секвенування клонів включає в себе картування хромосом і клонування до секвенування, тоді як клонування секвенуванням дробовиків опускає як картографування хромосом, так і етапи клонування під час секвенування.

Клон секвенуванням клонів та клон секвенуванням дробовиків - це два способи секвенування геномів сучасного часу. Клон секвенуванням клонів є більш надійним методом секвенування. Однак метод клонування послідовним дробовиком швидше і дешевше. У статті присвячена тонка різниця між клоном шляхом послідовності клонів та секвенуванням дробовиків.

ЗМІСТ

1. Огляд та ключові відмінності
2. Що таке клон шляхом секвенування клонів 
3. Що таке клон шляхом секвентування дробовика
4. Подібність між клоном шляхом секвенування клонів та послідовності рушниці
5. Порівняльне порівняння - Клонування шляхом клонування по секвенції проти послідовних рушниць у табличній формі
6. Підсумок

Що таке клон шляхом секвенування клонів?

Клон методом секвенування клонів є методом секвенування геному. Це вимагає складання карти кожної хромосоми до розщеплення ДНК. Після карти ДНК слід розбити на фрагменти довжиною 150 кілобаз. Ці фрагменти потім готові до послідовності. Наступним кроком є ​​вставка фрагментів ДНК у бактеріальні штучні хромосоми (BAC), а потім у бактеріальні клітини. Оскільки фрагменти зараз знаходяться всередині бактеріальної клітини, кожного разу, коли бактерії діляться, вставлені фрагменти ДНК також діляться і утворюють багато однакових копій. Потім окрему ДНК бактеріального клону фрагментують на 500 пар довгих фрагментів. Вони є меншими і перекриваються фрагментами. Далі секвенування відбувається із вставкою цих фрагментів у вектор із відомою послідовністю ДНК. Починаючи з відомої послідовності вектора, секвенування продовжується до невідомої послідовності.

Після закінчення секвенування необхідно визначити області послідовностей, що перекриваються. Після цього з'єднання фрагментів відбувається, щоб утворити більші фрагменти, спочатку представлені в BAC. Далі збирання більших фрагментів у хромосомі відбувається відповідно до карти геному.

Малюнок 01: Клон секвенуванням клонів

Істотною перевагою клону шляхом послідовності клонів є те, що попередньо підготовлена ​​карта геному допомагає надійній збірці більших фрагментів. Але недоліком цього методу секвенування є те, що він вимагає трудомісткого часу для генерування карт геному та створення клонів. Однак цей метод був кращим під час проекту "Геном людини".

Що таке клон шляхом секвентування дробовика?

Клон секвенуванням дробовиків - це метод секвенування, який випадковим чином розбиває послідовності ДНК на безліч дрібних фрагментів і повторно збирає послідовність, спостерігаючи ділянки, що перекриваються. Більші геноми ссавців важко клонувати послідовність і збирати. Це обумовлено їх структурною складністю та розмірами. Незважаючи на те, що клон методом секвенування клонів є надійним, потрібно тривати тривалий час для послідовності геномів складних організмів. Тому клон шляхом секвенування рушниць став надійним дешевшим методом секвенування, який можна виконати швидше. Отже, сучасні вчені покладаються на цей метод послідовності боротьби зі складними геномами.

Малюнок 02: Клон секвенуванням дробовика

Під час клонування методом секвенування рушниці не відбувається жодних звичайних етапів картографування геномів та клонування. Спочатку весь геном фрагментований на різні розміри від 20 кілобаз до 300 кілобаз. Далі відбувається послідовність. Потім, використовуючи складне комп'ютерне програмне забезпечення, необхідно зібрати фрагменти, переглянувши ділянки, що перекриваються.

Клон секвенуванням рушниць допомагає підвищити точність існуючих послідовностей геномів. Основна перевага цього способу полягає в тому, що він набагато швидший і дешевший, ніж клон методом секвенування клонів. Однак цей процес не передбачає використання генетичної карти. Отже, швидше трапляються помилки під час складання. Таким чином, це є головним недоліком у клонінгу методом секвенування рушниць.

Які схожість між клоном шляхом секвенування клонів та послідовності рушниці?

• Обидва клонування шляхом клонування секвенування та секвенування дробовиків є двома методами секвенування геному.
• Під час обох методів послідовності збирання розбитих фрагментів відбувається шляхом ідентифікації перекритих областей.
• Крім того, розбиття ДНК на більш дрібні фрагменти необхідне як для послідовності клонування, так і для рушниці.

Яка різниця між клоном за допомогою клоновної секвенування та послідовності рушниці?

Клон методом секвенування клонів включає два основні етапи: картографування хромосом та клонування. На відміну від цього, клон шляхом секвенування рушниці не відповідає цим двом крокам; він випадковим чином розбиває послідовності ДНК на безліч дрібних фрагментів і повторно збирає послідовність, спостерігаючи ділянки, що перекриваються. Отже, це ключова відмінність між клоном шляхом послідовності клонів та послідовності рушниць. Завдяки цьому фактору клон секвенуванням клонів є дорогим і трудомістким процесом, в той час як клон секвенуванням рушниць швидше і дешевше.

Однак помилки під час складання рідше трапляються під час клонування шляхом послідовності клонів. Отже, він має високу надійність. Однак клон шляхом секвенування рушниць є порівняно менш надійною технікою. Отже, це також суттєва різниця між клонуванням шляхом клонування секвенуванням та секвенуванням дробовиків.

Наведена нижче інформація-графіка подає більше інформації щодо різниці між клоном шляхом послідовності клонів та послідовності рушниць.

Підсумок - Клон секвенуванням клонів проти послідовних рушниць

Узагальнюючи різницю між клонуванням шляхом клонування секвенуванням і секвенуванням дробовиків, клон шляхом секвенування клонів і секвенування дробовиків є двома методами секвенування геному. Однак клон методом секвенування клонів включає в себе і процес картографування геному, і процес клонування, в той час як клонування шляхом секвенування рушниці не робить. Отже, це ключова відмінність між клоном шляхом послідовності клонів та послідовності рушниць. Оскільки відображення генома відбувається під час клонування шляхом клонування послідовностей, помилки рідше трапляються під час складання послідовностей. Але клон шляхом секвенування рушниць - набагато швидший і дешевший процес. Однак він порівняно менш надійний. Клон методом секвенування клонів був кращим методом секвенування під час проекту проекту геному людини. Але сучасний молекулярний біолог більше покладається на клон шляхом секвенування рушниць.

Довідка:

1. "Що таке послідовне клонування за клоном?" Факти, Команда громадської участі на кампусі геном "Геном", 17 листопада 2014 р., Доступна тут.
2. "Що таке послідовне рушницю?" Факти, Команда громадської участі на кампусі геном "Геном", 17 листопада 2014 р., Доступна тут.

Надано зображення:

1. "Кроки молекулярного клонування" Alexpicardal97 - власна робота, CC BY-SA 4.0) через Commons Wikimedia
2. «Послідовне рушничне рушницю» Національним інститутом досліджень геному людини - Національним інститутом здоров'я. Національний інститут досліджень геному людини "Розмовний словник генетичних термінів". Отримано 17 листопада 2016 року (загальнодоступне надбання) через Wikimedia Commons