Різниця між Космідом і Фагемідом

The ключова різниця між Cosmid і Phagemid знаходиться на типі послідовностей, які він містить. Cosmid містить cos-сайт і плазміду. Отже, це гібридний вектор, тоді як фагемід - плазміда, яка містить походження F1 реплікації фага F1.

Косміди та фагеміди використовуються для клонування, особливо для клонування більших фрагментів ДНК. Вони широко використовуються, особливо в клонуванні генів, відповідальних за виробництво різних білків. Косміди та фагеміди або реплікуються окремо у вигляді плазмід, або упаковуються у вірусні частинки, а потім реплікуються.

ЗМІСТ

1. Огляд та ключові відмінності
2. Що таке Косміда
3. Що таке фагемід
4. Подібність між Космідом і Фагемідом
5. Порівняльне порівняння - Космід проти Фагемід у табличній формі
6. Підсумок

Що таке Косміда?

Cosmid, який називають гібридною плазмідою, містить cos-сайти, витягнуті з частинок фага лямбда та плазміду. Ці cos-сайти - це довгі фрагменти ДНК з 200 базовими парами. Отже, вони мають згуртовані або липкі кінці, що дозволяють плазміді вписатися у вірусну ДНК. Тому сайти cos є життєво важливими для упаковки ДНК.

Є три cos-сайти;

• cosN-сайт - бере участь у занизуванні ланцюга ДНК активністю термінази
• сайт cosB - займається проведенням термінази.
• cosQ-сайт - бере участь у запобіганні деградації ДНК ДНКазами.

Малюнок 01: Косміда

Також Cosmids може або реплікувати одноланцюжкову ДНК або дволанцюжкову ДНК, використовуючи відповідне походження реплікації. Косміди зазвичай містять гени стійкості до антибіотиків як маркери для відбору трансформантів. Таким чином, використання косміди як вектора може полегшити клонування, а рестриктаза перетравлення вектора може потім витягти ці фрагменти.

Що таке фагемід (Фасміда)?

Фагемід, також названий як Фасміда, також є типом гібридного вектора. Фагемід містить особливе походження реплікації, що називається f1 походженням реплікації. Походження f1 реплікації витягує з f1 фага.

Фагемід може реплікувати як одноланцюжкову, так і дволанцюжкову ДНК. Реплікація може відбуватися як плазміда під час незалежної реплікації, або може бути упакована в фагові частинки і, нарешті, заразити господаря бактерій Е coli. При зараженні на Е coli клітин, фаг f1 вимагає наявності стовпа. Отже, сексуальні пілі важливі під час в пробірці упаковка фагемідів.

Які подібності між Космідом та Фагемідом?

• І Cosmid, і Phagemid - це вектори клонування, які використовуються в технології рекомбінантної ДНК.
• Космід і Фагемід можуть реплікувати одноланцюжкову і дволанцюжкову ДНК.
• Обидва можуть зазнати незалежної реплікації, подібної до плазмід.
• Косміда і Фагемід можуть пройти в пробірці упаковка та інфікування бактеріальних клітин.
• І Космід, і Фагемід потребують відповідного походження реплікації для клонування.

Яка різниця між Космідом та Фагемідом?

Космід проти Фагеміда
Космід - гібридний вектор, який містить сайт cos і плазміду.	Фагемід - плазміда, яка містить F1 походження реплікації фага F1.
Наявність космічних сайтів
Сайти Cos містяться в косміді і необхідні для пакування in vitro.	Сас-сайти у фагеміду відсутні.
Наявність F1 Походження реплікації
У косміді fi походження реплікації може або не може бути.	F1 походження реплікації присутнє у фагеміді.
Наявність антибіотиків, стійких до генів
Антибіотикорезистентні гени присутні у космідах для ідентифікації трансформантів від нетрансформантів.	У фагемідів відсутні гени, стійкі до антибіотиків.
Вимога упаковки in vitro
Потрібен сайт cos.	Потрібна секс-подушка.

Підсумок - Cosmid vs Фагемід

Cosmid і Phagemid - це вектори клонування, які використовуються в технології рекомбінантних ДНК. Косміди - це гібридні вектори, які містять спеціальні липкі кінці, відомі як cos сайти. в пробірці для упаковки потрібні ці сайти cos. Тоді як фагеміди є плазмідами, які містять f1 походження реплікації, витягнуту з f1 фага. І косміда, і фагемід можуть зазнавати самостійної реплікації або в пробірці упаковка для бактеріальних клітин. Це важливі відмінності між космідою та фагемідом.

Довідка:

1.Qi, H та ін. "Фагемідні вектори для відображення фагів: властивості, характеристики та побудова". Журнал молекулярної біології., Національна медична бібліотека США, 30 березня 2012. Доступний тут 
2. Колінз, Дж. Та Б Хон. "Косміди: тип вектора клонування плазмідних генів, який можна запакувати in vitro в головках лямбда-бактеріофага". Праці Національної академії наук Сполучених Штатів Америки, Національна медична бібліотека США, вересень 1978 р. Доступно тут  

Надано зображення:

1. 'Косміда (англійська)' Автор Zlir'a (CC0) через Wikimedia Commons