Різниця між виділенням геномної ДНК та плазмідної ДНК

The ключова різниця між геномною ДНК і плазмідною ізоляцією ДНК є те, що виділення геномної ДНК націлено на вилучення геномної ДНК, тоді як ізоляція плазмідної ДНК націлена на вилучення плазмідної ДНК бактерій.

Ізоляція ДНК - це хімічний процес, який використовується для виділення ДНК різних видів або з різних зразків. Виділення ДНК має важливе значення в методах молекулярної біології нижче, таких як гелевий електрофорез, ланцюгова реакція полімерази та методи секвенування ДНК. Тому виділення ДНК є важливим хімічним процесом у молекулярно-біологічних дослідженнях. Виходячи з мети дослідження, іноді виникає необхідність виділення геномної ДНК. Крім того, деякі дослідження зосереджуються на виділенні плазмідної ДНК від бактерій. Ізоляція геномної ДНК - це процес виділення геномної ДНК з прокаріотичного або еукаріотичного зразка. Етапи виділення відрізняються залежно від типу клітини, в якій виділяється ДНК. Виділення плазмідної ДНК - це процес виділення плазмідної ДНК з бактеріальної клітини. Порівняно з геномною ізоляцією ДНК, загальний процес є складним у виділенні плазмідної ДНК.

ЗМІСТ

1. Огляд та ключові відмінності
2. Що таке виділення геномної ДНК
3. Що таке виділення плазмідної ДНК
4. Подібність між геномною ДНК та виділенням плазмідної ДНК
5. Порівняльне порівняння - виділення геномної ДНК та плазмідної ДНК у табличній формі
6. Підсумок

Що таке виділення геномної ДНК?

Виділення геномної ДНК - це процес вилучення цілої геномної ДНК організму. Цей конкретний процес передбачає три основні події. Це лізис клітин або ядерний лізис, деградація білка або протеоліз та осадження геномної ДНК. Етап лізису може відрізнятися залежно від типу клітин. У прокаріотів, оскільки існує клітинна стінка пептидоглікана, першим кроком має бути розпад клітинної стінки. З іншого боку, у еукаріотів етап лізису передбачає розпад плазматичної мембрани та ядерної мембрани для виведення ДНК на зовнішній вигляд. На відміну від цього, необхідні спеціальні кроки для лізингу клітинних стінок рослини та грибів.

Малюнок 01: Виділення геномної ДНК

Отже, як тільки етап лізису завершиться, зрештою ДНК надійде до супернатанту. Одночасно в розчині відбувається також деградація білка за рахунок додавання протеїнази K. Наступним кроком є ​​відокремлення геномної ДНК та деградуючих білків один від одного. Отже, деградовані білки відокремлюються осадженням, завдяки чому геномна ДНК залишається в супернатанті. Після осадження білків геномну ДНК можна осадити і повторно суспендувати у відповідному буфері до тих пір, поки цього не потрібно для проведення експерименту.

Геномна ДНК, що є лінійною ДНК, містить всю генетичну інформацію організму. Іншими словами, геном - це матеріал спадковості живого організму, який відповідає за всі структурні та функціональні дії клітини. Він складається як з кодуючих, так і з некодуючих послідовностей ДНК. При виділенні геномної ДНК вона включає весь геном організму.

Що таке ізоляція плазмідної ДНК?

Ізоляція плазмідної ДНК - це особливий і більш складний процес виділення ДНК. Плазміди - це екстрахромосомна ДНК, присутня в більшості бактеріальних клітин. Вони є сплячою циркулярною ДНК, яка підтримує бактерії виживання в суворих екологічних умовах. Плазмідна ДНК складається з спеціальних стійких генів, які надають додаткові переваги бактеріям, такі як стійкість до антибіотиків, властивості вірулентності та токсичні властивості.

Малюнок 02: Виділення плазмідної ДНК

Виділення плазмідної ДНК також включає три основні процеси; клітинний лізис, протеїноліз та осідання ДНК. Хоча біохімічний механізм виділення подібний до механізму виділення геномної ДНК, процес є складнішим за нього. Процес лізису клітин є найважливішим у цій процедурі. Найголовніше, що геномна ДНК і плазмідна ДНК не повинні змішуватися між собою. Отже, значно більш м'який процес лізису включає процедуру виділення плазмідної ДНК. Отже, у більшості процедур виділення плазмідної ДНК використовують миючий засіб; додецилсульфат натрію для лізису клітин.

Які подібності між геномною ДНК та виділенням плазмідної ДНК?

• Виділення геномної ДНК і плазмідної ДНК зосереджено на вилученні ДНК з організму.
• Крім того, обидва слідують однаковим загальним процесом, який включає лізис клітин, деградацію білка та осідання ДНК.
• Крім того, одержувана ДНК обох процесів важлива для процесів нижче.
• Крім того, обидва процеси ізоляції включають етапи очищення та зберігання ДНК у визначених умовах зберігання.
• Крім того, протеїназа К використовується в обох методах для деградації білків.

Яка різниця між геномною ДНК та виділенням плазмідної ДНК?

Ізоляція геномної ДНК зосереджена на вилученні цілої геномної ДНК організму-мішені, тоді як виділення плазмідної ДНК фокусується на виділенні лише плазмідної ДНК з конкретних видів бактерій. Отже, це ключова відмінність між геномною ДНК та виділенням плазмідної ДНК. Крім того, ще одна відмінність між виділенням геномної ДНК і плазмідною ДНК полягає в процедурі. Виділення геномної ДНК є менш складною процедурою порівняно з виділенням плазмідної ДНК. Отже, при виділенні плазмідної ДНК необхідно вживати заходів безпеки, щоб запобігти змішуванню геномної та плазмідної ДНК між собою.

Нижче наводиться інфограохіка, яка надає додаткові відомості про різницю між геномною ДНК та виділенням плазмідної ДНК.

Підсумок - Ізоляція геномної ДНК проти плазмідної ДНК

Ізоляція ДНК є важливим процесом у методах молекулярної біології. Існує два типи ДНК, а саме геномна ДНК і плазмідна ДНК (екстрахромосомна ДНК). Виходячи з вимоги, деякі процедури проводяться для виділення геномної ДНК, тоді як деякі процедури фокусуються на виділенні лише плазмідної ДНК від бактерій. Отже, кроки, що беруть участь в обох процесах, трохи відрізняються один від одного. Однак загальний процес однаковий в обох ізоляціях. Ізольована ДНК обох процесів має неабияке використання у процесах нижчого течії, таких як клонування, гелефофорез та ланцюгові реакції полімерази. Наприкінці протоколу виділення геномної ДНК всю геномну ДНК організму можна виділити як кінцевий продукт, тоді як наприкінці протоколу виділення плазмідної ДНК плазмідну ДНК відповідної бактерії можна виділити як кінцевий продукт. Отже, це різниця між геномною ДНК та виділенням плазмідної ДНК.

Довідка:

1. "ЕКСТРАКЦІЯ ДНК З БАКТЕРІЇ". Вилучення ДНК з бактерій. Доступний тут 

Надано зображення:

1. «Вилучення ДНК» Джо Натха - Власна робота, (CC BY-SA 4.0) через Wikimedia Commons 
2. "Міні-підготовка плазмід" від Retama - Власна робота, (CC BY-SA 4.0) через Wikimedia Commons