Різниця між генотипізацією та секвенуванням

Ключова різниця - генотипізація та секвенування
 

Генотипізація та секвенування - це дві методики, що виконуються для отримання інформації про нуклеїнові кислоти, головним чином ДНК організму. Ключова відмінність між генотипуванням та секвенуванням полягає в тому, що генотипізація - це процес визначення того, який генетичний варіант має індивід за допомогою маркерів, а послідовність - це визначення правильного порядку нуклеотидної послідовності в межах заданого фрагмента ДНК.

ЗМІСТ
1. Огляд та ключові відмінності
2. Що таке генотипізація
3. Що таке послідовність
4. Поплечне порівняння - генотипізація та послідовність
5. Підсумок

Що таке генотипізація?

Генотипізація - це визначення генетичного складу індивіда за допомогою послідовності ДНК та маркерів та порівняння та ідентифікація його спадщини. Генотипізація важлива в еволюційній біології, біології населення, систематиці, екології та генетиці організмів. Він може бути виконаний різними методами, включаючи секвенування ДНК, ланцюгову реакцію полімерази, поліморфізм довжини рестрикції (RFLP), випадкове посилене поліморфне виявлення, поліморфізм ампліфікованої довжини фрагмента (AFLP), мікроматриці ДНК тощо.

Генотипізація передбачає секвенування окремих невеликих фрагментів послідовностей ДНК та виявлення спорідненості генетичного складу з іншими людьми за допомогою генетичних маркерів. Він визначає поодинокі нуклеотидні поліморфізми (SNP) серед особин або специфічних алелей. Генотипізація застосовна для широкого кола організмів, включаючи людину. Він також застосовний до мікроорганізмів, таких як віруси, гриби тощо, і може бути використаний для визначення їх генетичних варіантів за референтними профілями. У молекулярній епідеміології та криміналістичній мікробіології контроль над патогенами, особливо мікроорганізмами, здійснюється за інформацією, отриманою при генотипуванні. Генотипінг дуже важливий у родоводушному аналізі. Люди генотипуються для підтвердження материнства та батьківства. Генотип виявить домінантні та рецесивні алелі генів, які визначають конкретні риси.

Рисунок_1: Генотипізація RFLP

Що таке секвенування?

Послідовність - це процес визначення правильного порядку нуклеотиду в заданому фрагменті ДНК або РНК. Практично вся інформація, необхідна для росту та розвитку організму, закодована у його геномі. Наявність методик для отримання та відокремлення декількох сотень нуклеотидів довгими фрагментами нуклеїнових кислот призвела до розробки процедур визначення точної нуклеотидної послідовності заданого фрагмента ДНК або РНК. Сьогодні доступні різні типи послідовних методів. Ці методи секвенування разом з технологіями побудови бібліотек геномів, що представляють весь геном організму, полегшують послідовність цілого геному цього організму, роблячи глибокий аналіз генних структур, функцій генів, розташування генів, експресії генів, генографічне відображення, регуляторні регіони генів тощо.

Загальні геноми багатьох вірусів, декількох бактерій, архебактерій, дріжджів та декількох інших організмів було простежено та картографировано. Проект геному людини дозволив послідовно встановити послідовність і скласти карту всього геному людини та опублікувати його перший проект у 2003 році. Це головна віха в просуванні біології. Послідовності геномів людини зараз використовуються в медичній галузі для виявлення генетичних причин рідкісних захворювань, ризику скринінгу захворювань у новонароджених, виявлення генетичних деталей різних видів раку, розробки нових терапевтичних засобів та розробки нових засобів діагностики тощо.

У рослинному світі геном рису та геноми арабідопсису були послідовні. Знання цих послідовностей, безсумнівно, революціонує наше розуміння того, як функціонують клітини та організми.

Рисунок_2: Авторадіограф безпечного послідовності

Яка різниця між генотипізацією та секвенуванням?

Генотипізація проти секвентування
Генотипізація - це процес визначення генетичного складу індивіда та перевірка групи або систематики цього організму.	Послідовність послідовностей - це процес визначення точного порядку нуклеотидів даного фрагмента ДНК або РНК.
Техніки
RFLP, секвенування генів, ПЛР, мікроматриці ДНК, AFLP тощо.	Сингерне ​​секвенування, послідовності Гілберта, піросеквенціювання, послідовність наступного покоління, послідовність рушниць тощо.
Основні проблеми
Це більше стурбовано тим, чи генотипові відмінності дають фактичні відмінності у фенотипі.	Це більше стурбовано порядком нуклеотидів та його відмінностями та змінами з іншими організмами.

Підсумок - Генотипізація та секвенування

Генотипізація та секвенування корисні для вивчення генетичної інформації організмів. Генотипізація - це процес визначення варіацій генотипу серед індивідів та знаходження їх категорій. Послідовність - це процес визначення правильного порядку нуклеотидів в зацікавленому фрагменті або області ДНК. Обидві методи дають важливу інформацію про гени та геноми.

Довідка:
1. «Методи генотипізації». Методи молекулярної біології (Кліфтон, Н. Дж.). Національна медична бібліотека США, n.d. Веб. 20 лютого 2017 року.
2. Akey, J. M., D. Sosnoski, E. Parra, S. Dios, K. Heister, B. Su, C. Bonilla, L. Jin, M. D. Shriver. "Кривий аналіз плавлення SNPs (McSNP ): безгелевий і недорогий підхід для генотипування SNP". BioTechniques 30.2 (2001): 358-67. Веб.

Надано зображення:
1. "RFLP генотипізація" Автор (невідомо) - Національний інститут охорони здоров'я (Public Domain) через Commons Wikimedia
2. "Радіоактивний флуоресцентний" Абізар в англійській Вікіпедії (CC BY-SA 3.0) через Вікісховище