Різниця між мотивом і доменом

The ключова різниця Між мотивом і доменом є те, що мотив не є незалежно стабільним, тоді як домен незалежно стабільний.

Білки - важливі біологічні макромолекули, присутні в нашому організмі. З іншого боку, генетичний код гена визначатиме амінокислотну послідовність білка. Більше того, білки мають первинну, вторинну та третинну структури. Первинна структура - це амінокислотна послідовність поліпептидного ланцюга. Коли поліпептидні ланцюги складаються один з одним, він утворює вторинну структуру білка. Альфа-спіралі, бета-листи та над-вторинні структури належать до вторинних структур. Певні угруповання над-вторинних елементів відомі як білкові мотиви. Третинна структура білка відноситься до його тривимірної структури, яка визначає функцію білка. Домен - складений ділянку білкової молекули, який є кульовим і має дискретну функцію. Це фундаментальна функціональна і тривимірна структура білка.

ЗМІСТ

1. Огляд та ключові відмінності
2. Що таке мотив
3. Що таке Домен
4. Подібність між мотивом і доменом
5. Порівняльне порівняння - мотив та домен у табличній формі
6. Підсумок

Що таке мотив?

Мотив - це певне групування над вторинних елементів білків, таких як альфа-спіралі та бета-структури. Вони є деякими візерунками, присутніми в різних білках. Мотиви описують закономірності складання вторинних структурних елементів та їх взаємодії. Ці складові структури стабілізуються за допомогою подібних зв'язків, які є в третинних структурах. Однак вони не такі складні, як третинні структури.

Малюнок 01: Мотив

Вони є простими комбінаціями вторинних структур білків. Мотив не стійкий сам по собі. Крім того, мотиви пояснюють структуру білка, але не передбачають функції білка. Прикладами білкових мотивів є бета-альфа-бета-мотив, грецький ключовий мотив, бета-бочка, мотив бета-меандру тощо.

Що таке Домен?

Домен - це фундаментальна, функціональна і тривимірна одиниця білка. Він виконує певну функцію. Один білок може мати кілька різних доменів. Кожен домен - це незалежна одиниця. Це кульова структура. Він відповідає за конкретну функцію або взаємодію. Домени можна використовувати для гіпотезизації функції нехарактерного білка. При аналізі білка важливо враховувати, оскільки домени є функціональними одиницями білка.

Малюнок 02: Три різні домінки піруваткінази

Домени - це дуже стабільні та компактні структури. Їх легко відрізнити від інших регіонів. Піруваткіназа має три відмінні домени, як показано на малюнку 02. Довжина домену може змінюватися, а середня довжина - 100 амінокислот. Кожен домен містить гідрофобне ядро, побудоване з вторинних структурних одиниць. Кілька доменів спільно складають третинну структуру білка.

Які подібності між мотивом та доменом?

• Мотив і домен - це одиниці, присутні в самих молекулах білка.
• Вони корисні при класифікації сімейств білків.

Яка різниця між мотивом та доменом?

Мотив - це певне групування над вторинних елементів білків, таких як альфа-спіралі та бета-структури, тоді як домен є функціональною одиницею білка. Крім того, мотив є вторинною структурою, тоді як домен відповідає за третинну структуру білка. Більше того, домен - це незалежна одиниця, на відміну від мотиву. Також домен зображує функцію білка, а мотив - ні. Це основні відмінності між мотивом і доменом. Інфографіка нижче представлена ​​різницею між мотивом та доменом у табличній формі.

Підсумок - Мотив проти домену

Мотив - це розташування вторинних структур молекули білка. Зазвичай він не є стабільним сам по собі, на відміну від домену. Домен - це незалежно стабільна структура білка. Тому це може бути частина або ціла молекула білка. Це тривимірна фундаментальна функціональна одиниця білка. Більше того, він має функцію, і це самостійний підрозділ. Мотив може бути частиною домену. Але домен не може бути частиною мотиву. Це різниця між мотивом і доменом.

Довідка:

1. "Домен протеїну". Вікіпедія, Фонд Вікімедіа, 31 липня 2018 р. Доступний тут

Надано зображення:

1. "Основний мотив білка токсину токсину сибірки" Автор NatelewisDerivative work (CC BY-SA 3.0) через Commons Wikimedia
2. "Домени білків піруваткінази" Томас Сплеттстоссер - власна робота, (CC BY-SA 3.0) через Wikimedia Commons