Різниця між Phusion та Taq полімеразою

Ключова різниця - Phusion vs Taq Полімераза
 

ДНК-полімерази широко використовуються ферментами в методиках молекулярної біології, а також природним чином присутні у всіх організмах, які піддаються реплікації ДНК. Вони є ключовими полімеризуючими ферментами, які беруть участь під час реплікації. ДНК-полімераза здатна додавати нуклеотиди до вільного 3 'кінця ланцюга ДНК, тим самим викликаючи розширення нової ланцюга. В даний час через розвиток молекулярної біології в діагностиці захворювань та промисловому застосуванні важливо виготовляти полімерази, що мають різні корисні властивості. Це підвищує точність методу і робить його більш швидкою технікою. Phusion та Taq полімераза - це два комерційно виготовлені термостабільні ферменти полімерази, які використовуються у спеціальних молекулярних програмах. Ф'юзія - це ДНК-полімераза, виділена з Pyrococcus furiosus і в основному використовується в експериментах з клонування для підвищення вірності. Taq ДНК-полімераза - це стандартна ДНК-полімераза, яка використовується в ланцюговій реакції полімерази (PCR), і її виділяють з термостабільної бактерії; Thermus aquaticus. The ключова різниця між двома ферментами є вихідний мікроорганізм. Фізію виділяють із екстремофілу, Pyrococcus furiosus тоді як полімераза Taq виділена з термофіла, Thermus aquaticus.

ЗМІСТ

1. Огляд та ключові відмінності
2. Що таке Фьюзія
3. Що таке полімераза Taq
4. Подібність між Phusion та Taq Polymerase
5. Порівняльне порівняння - полімераза Phusion vs Taq у табличній формі
6. Підсумок

Що таке Фьюзія?

Фьюзійна ДНК-полімераза являє собою нову полімеразу, яку отримують шляхом виділення ферменту з Pyrococcus furiosus, що є екстремофільною Археєю. Ці мікроби мешкають в надзвичайно високотемпературних умовах, завдяки чому полімераза стає високоміцною термостійкою полімеразою. Фьюзійну полімеразу використовують для отримання надзвичайної вірності щодо звичайної термостабільної полімерази; Taq полімераза. Фізійна полімераза здатна ампліфікувати довгі шаблони до 7,5 кб геномної ДНК. Оптимальна здатність полімеризації ф'юзійної полімерази становить 72⁰ C. Phusion використовується також у клонуванні продуктів для секвенування, аналізу експресії та мутаційного аналізу.

Ф'юзійна ДНК-полімераза має 3 '- 5' екзонуклеазну активність. Це дозволяє коректувати щойно синтезовану нитку після синтезу. Отже, нуклеотидні невідповідності легко виправляються. Таким чином, він має менший показник помилок. Загальні переваги полімераз Phusion:

• Надзвичайна вірність
• Висока швидкість та скорочення часу розширення
• Надійна реакція і вимагає мінімальної оптимізації
• Висока прибутковість

Малюнок 01: Фізіон

Основний недолік полімераз Phusion полягає в тому, що він інгібується в присутності дезоксиуридин трифосфату (dUTP). Коли dUTP накопичуються в реакційній суміші, це може пригнічувати дії фьюзіон-полімерази. Це запобігає обробці реакційної суміші з dUTPase перед додаванням ферменту. В даний час стійкий до dUTP варіант Phusion полімерази, відомий як Pfu Turbo, застосовується замість Phusion polmerase як спосіб вирішення цієї проблеми..

Що таке полімераза Taq?

Taq ДНК-полімераза Винахід здійснив революцію в галузі молекулярної біології. Це вирішило головну проблему в ампліфікації ДНК. Taq ДНК-полімераза - це термостійкий фермент полімерази, що витягується та виділяється з термофільної бактерії, Thermus aquaticus. Відкриття цього ферменту призводить до розвитку ПЛР. Цей фермент дозволив використовувати ланцюгову реакцію полімерази для ампліфікації ДНК замість звичайних трудомістких методів клонування. ПЛР зараз застосовується в молекулярній діагностиці, сільськогосподарських та промислових галузях, і багато нових варіацій додаються до методики.

Малюнок 02: Полімераза Taq

Taq ДНК-полімераза функціонує в оптимальному діапазоні температур між 72⁰С - 80⁰C. Taq ДНК-полімераза потребує ко-фактора; магній для своєї функції. Полімераза Taq не має здатності до коректування 3 '- 5', тому частота помилок ДНК-полімерази Taq є високою порівняно з більш новими типами ДНК-полімераз, такими як ПФУ-полімераза тощо. однаковий у всьому світі через зручність та гнучкість ферменту.

Які подібності між Phusion та Taq полімеразою?

• Фензію та ферменти Taq полімерази є полімеризуючими ферментами, які здатні додавати нуклеотиди до 3 'вільного кінця ланцюга ДНК.
• Полімерази Phusion і Taq потребують послідовності праймера для ініціації полімеризації.
• Полімерази Phusion і Taq є стійкими до жару.
• Полімерази Phusion і Taq використовуються в механізмах ПЛР для ампліфікації ДНК.
• При додаванні полімерази до реакційної суміші останні полімерази Phusion та Taq додаються останніми для забезпечення ефективності ферменту.
• Полімерази Phusion і Taq комерційно синтезуються для експериментальних цілей молекулярної біології.
• Полімерази Phusion і Taq потребують кофактора, щоб виконати свою функцію.

Яка різниця між Phusion та Taq полімеразою?

Полімераза Phusion vs Taq
Ф'юзія - це ДНК-полімераза, виділена з Pyrococcus furiosus і в основному використовується в експериментах з клонування для підвищення вірності.	Taq ДНК-полімераза - це стандартна ДНК-полімераза, яка використовується в ланцюговій реакції полімерази (PCR), і її виділяють з термостабільної бактерії, Thermus aquaticus.
Джерело Організм
Фізію добувають з екстремофільних арх - Pyrococcus furiosus.	Ці літературні твори охоплюють від періоду колонізації до періоду деколонізації.
Здатність до читання
3 '- 5' доказ здатності до читання присутній у Phusion.	3 '- 5' здатність до читання в полімеразі Taq відсутня.
Вірність
Висока вірність є у Phusion.	Полімераза Taq демонструє низьку точність.
Ампліфікація
Фьюзія здатна ампліфікувати довгі фрагменти ДНК.	Полімераза Taq здатна ампліфікувати набагато більш короткі фрагменти ДНК.
отруєння dUTP
Фізійна дія гальмується за рахунок непарного накопичення.	Полімераза Taq не інгібується dUPT.

Підсумок - Фьюзінг проти Так полімераза

Phusion та Taq ДНК-полімераза - дві теплостійкі полімерази, які використовуються в методах ПЛР. Ф'юзія - це полімераза, виділена з екстремофілу, Pyrococcus furiosus тоді як Taq виділений від термостабільних бактерій Thermus aquaticus. Відкриття Taq ДНК-полімерази призводить до винаходу ПЛР. Phusion має багато переваг перед Taq, що зробило Phusion кращим варіантом у виробництві ДНК з високою точністю. Однак полімераза Taq все ще використовується як стандартний фермент полімерази в ПЛР. Це різниця між Phusion та Taq полімеразою.

Довідка:

1. Біолаби, Нова Англія. "Полімерази ДНК Taq". New England Biolabs: реагенти для індустрії наук про життя. Доступний тут  
2. "Полімераза ДНК-ф'юзії". Нові Англії Biolabs. Доступний тут 

Надано зображення:

1.'ГРАМ, проілюстрований Нівіном Насрі'Бі NivinN - Власна робота, (CC BY-SA 4.0) через Wikimedia Commons  
2.'Taq'By Adenosine - Власна робота, (CC BY-SA 3.0) через Wikimedia Commons