Різниця між цілеспрямованою та ненапруженою протеомікою

Ключова відмінність між цілеспрямованою та ненавмисною протеомікою полягає в тому, що цільова протеоміка спрямована на вимірювання кількості певного білка, тоді як незатребувана протеоміка не націлена на конкретний білок.

Протеоміка - це масштабне дослідження білків, їх структур та функцій. Він вивчає весь білковий комплемент у клітині, тканині або організмі в конкретних умовах. Існує два типи протеомік, як цільова протеоміка і незатребувана протеоміка.

ЗМІСТ

1. Огляд та ключові відмінності
2. Що таке цільова протеоміка
3. Що таке незахищена протеоміка
4. Подібність між цілеспрямованою та ненав’язаною протеомікою
5. Порівняльне порівняння - цільова проти незатребуваної протеоміки у табличній формі
6. Підсумок

Що таке цільова протеоміка?

Як видно з назви, цільова протеоміка націлена на конкретний білок або пептид у складній суміші білків для аналізу. Потім він аналізує наявність та кількість цього попередньо вибраного специфічного білка. Цей спосіб можливий лише для однієї вибірки або для кількох зразків. Цей спосіб підходить навіть для певної групи білків. Це призводить до отримання більш точних, кількісних та чутливих даних. Більше того, мас-спектрометрія в поєднанні з цільовою протеомікою дає більш точні надійні вимірювання. Цей метод використовує для свого аналізу потрійний квадрупольний мас-спектрометр (QQQ).

Малюнок 01: Протеоміка

Цільова протеоміка є підходящим методом, якщо ви хочете перевірити, чи справді збита ціль збита, або коли ви хочете кількісно визначити конкретний білок / пептид у сироватці крові, церебральній рідині або в лізаті клітин тощо. Ви також можете використовувати його, якщо хочете щоб перевірити, чи певний білок диференційовано експресується в зразках або під час експерименту з часовим курсом.

Що таке незахищена протеоміка?

Ненапружений протеомік, як згадується в назві, не спрямований на конкретний білок або пептид для його аналізу. Відкриття протеоміки це ще одна назва для незатребуваних протеомік. Насправді це більш «глобальний» аналіз. Як правило, здійснення незарядженої протеоміки - це відповідь на питання "який білок або білки є в цьому зразку чи декількох зразках?". Цей метод не чутливий як цільова протеоміка. Але він може визначити і виміряти багато білків, включаючи нові білки. Ненапружена протеоміка може проводити як кількісні, так і якісні вимірювання.

Назвіть схожість між цільовою та ненав’язаною протеомікою?

• І цілеспрямована, і незатребувана протеоміка вимірюють білки в зразках.
• Вони важливі при аналізі протеоми.
• Ці методи використовують мас-спектрометрію.

Яка різниця між цілеспрямованою та ненав’язаною протеомікою?

По-перше, цілеспрямована протеоміка - це визначення присутності та кількості конкретного білка або пептиду в складної суміші білків. Навпаки, незатребувана протеоміка - це кількісне та якісне дослідження білків, присутніх у зразку чи зразках, не орієнтуючись на конкретний білок. Націлену протеоміку проводять із попередньо вибраними або цільовими білками, тоді як незахищена протеомія проводиться для з'ясування типів білків у цьому зразку. Більше того, цільова протеоміка є більш чутливою, ніж незатребувана протеомія.

Підсумок - Цільова проти незатребуваної протеоміки

Підводячи підсумок, цілеспрямована і незатребувана протеоміка - це два типи білкових досліджень. Як випливає з їхніх назв, цільова протеоміка націлена на конкретний білок, в той час як незаражена протеоміка не націлена на конкретний білок. Це різниця між цілеспрямованою та ненавмисною протеомікою.

Довідка:

1. "Цільова протеоміка". UC Davis Proteomics Core, доступний тут.
2. «Протеоміка / Вступ до протеоміки». Теорія музики / Режими - Wikibooks, Відкриті книги для відкритого світу, доступні тут.

Надано зображення:

1. "Proteomics" від Xxl7441 в англомовній Wikibooks - Перенесено з en.wikibooks у Commons (Public Domain) через Commons Wikimedia