Аллотропи є різними структурними модифікаціями елемента, тоді як ізомери є хімічними сполуками, які мають однакову молекулярну формулу, але мають різні структурні формули.
Певні елементи можуть існувати у двох або більше різних формах. Ці форми називаються алотропи в якій атоми елемента пов'язані між собою по-різному. Наприклад, діоксиген (O2), озон (О3), тетраоксиген (О4) та октаоксигену (О8) є
І алотропія, і ізомерія були концепціями, запропонованими шведським вченим Йенсом Якобом Берзеліусом. Він запропонував концепцію о алотропія в 1841 р. Після прийняття гіпотези Авогадро в 1860 р. було зрозуміло, що елементи можуть існувати як багатоатомні молекули, а два алотропи кисню були визнані O2 і О3. На початку 20 століття було визнано, що інші випадки, такі як вуглець, були зумовлені відмінностями в структурі кристалів.
Ізомерія вперше була помічена в 1827 році, коли Фрідріх Волер приготував синюшну кислоту і зазначив, що хоча її елементарний склад був ідентичний фульмінової кислоти (приготований Джастусом фон Лібігом у попередньому році), її властивості були зовсім іншими. Цей висновок поставив під сумнів переважаюче хімічне розуміння того часу, яке свідчило про те, що хімічні сполуки можуть бути різними лише тоді, коли вони мають різні елементарні композиції. Після додаткових відкриттів такого ж роду, як відкриття Волером 1828 року, що сечовина має той же атомний склад, як хімічно відомий ціанат амонію, Йенс Якоб Берцеліус ввів цей термін ізомерія описати явище.
Різні класи ізомерів включають стереоізомери, енантіомери та геометричні ізомери.
Типи ізомерів