Ендонуклеаза проти Екзонуклеаза
Ендонуклеаза та екзонуклеаза - це нуклеазні ферменти, які каталізують гідроліз одиничних нуклеотидів, присутніх у ланцюзі ДНК. Нуклеази відіграють життєво важливу роль в аналізі послідовності нуклеотидів у ДНК та РНК.
Екзонуклеаза
Ферменти екзонуклеази - це категорія ферментів, які розщеплюються до нуклеотидів на кінцях молекули ДНК. Дві нитки ДНК взаємодоповнюють один одного. Вони представлені як 3 'та 5' зброя. Фосфодіефірні мости ДНК та РНК атакуються двома класами ферментів, які представлені як "a" та "b". Ферменти групи "а" конкретно гідролізують складні ефіри між 3 'вуглецем, а фосфорна група та ферменти групи "b" гідролізують складні ефіри між 5' вуглецем і фосфорною групою.
Хорошим прикладом ензиму екзонуклеази групи є отрута гримучої змії та гадюки Рассела. Ця отрута гідролізує всі 3 'зв’язки в ДНК або РНК, вивільняючи нуклеотидні одиниці як нуклеозидні 5' фосфати.
Ферменти класу «b» представлені фосфодіестеразою селезінки, яка гідролізує всі зв'язки «b» або 5 'як ДНК, так і РНК і, таким чином, вивільняє лише нуклеозидні 3' фосфати.
Ендонуклеаза
Ферменти ендонуклеази - це ферменти, які розщеплюються до зв’язків ДНК зсередини молекули. Вони не потребують вільної 3 'або 5' гідроксильної групи в кінці полінуклеотидного ланцюга. Ендонуклеази атакують специфічні 3 'або 5' зв’язки, де б вони не траплялися в полінуклеотидній ланцюзі.
Ендонуклеази також класифікуються на групи "а" та "б". Дезоксирибонуклеаза I великої рогатої худоби класифікується як фермент класу "а", що каталізує гідроліз деяких з 3 'зв'язків ДНК, одержуючи олігонуклеотиди, що містять в середньому близько чотирьох нуклеотидних залишків..
Деоксирибонуклеаза II - ще одна ендонуклеаза класу "b". Він виділяється із селезінки та вилочкової залози різних бактерій і викликає гідроліз 5 'зв’язків, що призводить до групи нуклеотидів.
Підсумок:
1. Ексонуклеаза викликає гідроліз нуклеотиду на кінцях, де вільна 3 'або 5' гідроксильна група присутня в полінуклеотидній ланцюзі, тоді як для екзонуклеази не потрібна вільна 3 'або 5' гідроксильна група, щоб викликати гідроліз полінуклеотидної ланцюга.
2. Екзонуклеазна активність призводить до нуклеозидів, тоді як активність ендонуклеази призводить до олігонуклеотидів.
3. Активність екзонуклеази призводить до невеликих одиниць полінуклеотидного ланцюга майже відразу, тоді як активність ендонуклеази проходить фазу відставання перед вивільненням олігонуклеотидних груп.
4. Фосфодіестераза селезної отрути та селезінки є прикладами екзонуклеаз, тоді як дезоксирибонуклеаза I та II є прикладами ендонуклеаз.