Різниця між Exome і Transcriptome

Ключова різниця - Exome vs Transcriptome
 

Ген містить кодуючі та некодируючі області всередині нього. Кодуючі послідовності відомі як екзони, а некодуючі послідовності відомі як інтрони. Нуклеотидна послідовність екзонів гена являє собою генетичний код гена для синтезу специфічного білка. Отже, екзони залишаються в молекулі мРНК. Загальна область екзому геному відома як екзема, і вона є важливою частиною геному. Генетичний код генів перетворюється в генетичний код молекули мРНК, який необхідний для виробництва білка. Цілі молекули мРНК, транскрибовані в клітині або популяції клітин за один раз, відомі як стенограми. Ключова відмінність між exome і transcriptome полягає в тому, що exome являє собою послідовності областей екзону геному поки транскриптом являє собою загальну мРНК клітини або тканини в даний момент часу.

ЗМІСТ
1. Огляд та ключові відмінності
2. Що таке Exome
3. Що таке стенограма
4. Побічне порівняння - Exome vs Transcriptome
5. Підсумок

Що таке Exome?

Гени складаються з екзонів, інтронів та регуляторних послідовностей. Екзони - це області генів, які транскрибуються в послідовність мРНК під час транскрипції. Під час транскрипції видаляються інтрони та інші не кодуючі області. Нуклеотидна послідовність екзонів визначає генетичний код гена, який синтезує специфічний білок, який він кодує. Лише екзони залишаються в межах мРНК білка. Колекція екзонів у геномі відома як екзома організму. Він являє собою частину геному, яка експресується в генах. У людини екзома становить 1% від геному. Це частина білка, що кодує геном людини.

Малюнок 01: Exome

Що таке стенограма?

Транскриптом - це сукупність усіх кодируючих протеїном і некодируючих стенограм (РНК) в даній тканині. Транскриптом представляє сукупність молекул загальної мРНК, експресованої генами в клітині або тканині. Транскрипт клітини може змінюватись за допомогою стенограми іншого типу клітин. Транскриптом також динамічний - він змінюється з часом у відповідь як на внутрішні, так і на зовнішні подразники. Навіть у межах однієї тканини або в межах одного типу клітин транскрипт може змінюватися через кілька хвилин.

Транскриптом відрізняється від екзому організму. Транскриптом включає лише виражені послідовності exome. Хоча екзома клітини залишається однаковою, транскриптом відрізняється між клітинами, оскільки експресія генів однакова для всіх клітин або тканин. В різних клітинах і тканинах експресуються лише незамінні гени. Експресія генів - це специфічний для тканини або клітин клітин тип. Це регулюється різними факторами, включаючи фактори навколишнього середовища. Тому транскрипт може змінюватись в залежності від зовнішніх умов середовища.

Транскриптом використовується як попередник для досліджень на протеоміку. Всі білки отримані з послідовностей мРНК. Поступальні модифікації можуть призвести до зміни білків. Однак транскрипт дає важливу основну інформацію для протеомічних досліджень.

Малюнок 02: Транскрипт ембріональних стовбурових клітин

Яка різниця між Exome і Transcriptome?

Exome vs Transcriptome
Exome - це колекція білково-кодуючої області генів.	Транскриптом - це сукупність усієї транскрибованої РНК, включаючи мРНК.
Зразок
Exome вивчають за допомогою зразка ДНК.	Транскриптом вивчають за допомогою зразка РНК.
Метод дослідження
Послідовність цілого екзому - це метод вивчення ексом.	РНК-секвенування - це метод дослідження стенограми.

Підсумок - Exome vs Transcriptome

Екзони - це кодуючі послідовності генів і визначають послідовності мРНК білків. Колекція цих кодуючих послідовностей (екзонів) відома як екземуція організму. Гени транскрибуються в молекули мРНК до отримання білків. Загальні молекули мРНК клітини або тканини в будь-який момент часу відомі як стенограми. Транскриптом представляє гени, які активно експресуються в мРНК в будь-який момент часу. Транскриптом є специфічним для клітин і тканин і впливає на умови навколишнього середовища. Це різниця між exome і transcriptome.

Список літератури:
1. Сара та ін, «Цільовий захоплення та масове паралельне розподіл дванадцяти людських доходів». Природа. Національна медична бібліотека США, 10 вересня 2009 року. Веб. 01 квітня 2017 року
2.Муц та ін. "Транскрипційний аналіз з використанням послідовності наступного покоління". Ельзев'є: Локатор статей. N.p., вересень 2012. Веб. 01 квітня 2017 року

Надано зображення:
1. "Стенограма плюрипотентних клітин" Гршкович, М. та Рамалхо-Сантос, М., Плюріпотентна стенограма (10 жовтня 2008 р.), StemBook, ред. Спільнота досліджень стовбурових клітин, StemBook, doi / 10.3824 / stembook.1.24.1, http://www.stembook.org. - [1] DirectStemBook Рисунок 2 Транскрипт плюрипотентних клітин.Грскович, М. та Рамалхо-Сантос, М., Плюріпотентний стенограф (10 жовтня 2008 р.), StemBook, ред. Спільнота досліджень стовбурових клітин, StemBook, doi / 10.3824 / створіння.1.24.1, (CC BY 3.0) через Commons Wikimedia