Різниця між протеомікою та метаболомікою

The ключова різниця між протеомікою та метаболомікою є те протеоміка - це вивчення всіх білків організму, тоді як метаболомія - це вивчення всіх метаболітів організму.

Геноміка - це вивчення генетичного складу організму. Протеоміка та метаболомія - дві омічні науки, пов'язані з геномікою. Протеом відноситься до всіх білків у клітині чи організмі. Метаболом, з іншого боку, відноситься до всіх метаболітів організму. Таким чином, вивчення протеоми є протеомікою, тоді як дослідження метаболоми є метаболомікою. І протеоміка, і метаболомія мають важливе значення в діагностиці захворювань, в характеристиці та скринінгу організмів. Більше того, обидва пов'язані у багатьох аспектах клітинної біології, особливо у клітинній сигналізації, деградації білків та генерації та посттрансляційній модифікації.

ЗМІСТ

1. Огляд та ключові відмінності
2. Що таке протеоміка
3. Що таке метаболомія
4. Подібність між протеомікою та метаболомікою
5. Побічне порівняння - протеоміка проти метаболоміки в табличній формі
6. Підсумок

Що таке протеоміка?

Протеома - це загальний білковий комплемент у клітині, тканині чи організмі. Тому протеоміка - це вивчення протеоми організму. У протеоміці аналізуються різні характеристики білків. Тому протеоміка в основному зосереджується на структурі, орієнтації, функціях, взаємодії білка, модифікаціях, застосуванні та важливості білків. Саме тому в даний час проводиться багато дослідницьких проектів у галузі протеоміки.

Перші протеомічні дослідження були зроблені для виявлення вмісту білка в кишці. Відображення загального вмісту білка проводили за допомогою двовимірних (2D) гелів. Після успіху цього проекту вчені перейшли до характеристики загального вмісту білка в тварин, таких як морські свинки та миші. В даний час картування білків людини проводиться за допомогою 2D гель-електрофорезу.

Існує багато переваг вивчення протеоміки, оскільки білки є керуючими молекулами більшої активності завдяки властивості каталізаторів білків. Таким чином, вивчення цілих білків може дати інформацію про стан здоров’я організму. Більше того, протеоміка має багато застосувань у анотації геному, ідентифікації хвороби та діагностиці, проведенні досліджень експресії білка під час експериментів, модифікацій білка та досліджень взаємодії тощо.

Малюнок 01: Протеоміка

Існують різні методики, що беруть участь у протеоміці, включаючи вилучення загального білка, відділення їх за допомогою 2D гель-електрофорезу, секвенування витягнутих білків з використанням таких методів, як метод секвенування Едмунда або мас-спектрометрія та аналіз структурних та функціональних властивостей білка з використанням комп'ютерне програмне забезпечення та засоби біоінформатики.

Що таке метаболомія?

Метаболомія - це вивчення всіх метаболітів у клітині, тканині чи організмі. Він включає ідентифікацію та кількісну оцінку клітинних метаболітів, використовуючи різні передові аналітичні та статистичні засоби. Метаболомія є важливим дослідженням, оскільки вона розкриває інформацію щодо метаболізму в організмі.

Малюнок 02: Метаболомія

Для вивчення субстратів та продуктів метаболічних реакцій метаболомія використовує мас-спектрометрію як аналітичну платформу. Масова спектрометрія призводить до метаболітів та їх концентрацій, що відображають фактичний біохімічний стан клітин або тканин. Отже, метаболоміку можна розглядати як найкраще представлення молекулярного фенотипу організму. На додаток до них, метаболомічні засоби можна розглядати як продовження протеоміки, оскільки більшість метаболітів утворюється завдяки діяльності ферментів, які є білками.

Які подібності між протеомікою та метаболомікою?

• Протеоміка та метаболомія - дві омічні науки, пов'язані з геномікою.
• Метаболоміку можна розглядати як продовження протеоміки.
• Протеоми та метаболоми тісно переплітаються з багатьма дослідженнями.

Яка різниця між протеомікою та метаболомікою?

Протеоміка - це масштабне дослідження білків, включаючи їх структуру та функціонування в клітині чи організмі. Тим часом метаболомія - це вивчення метаболітних профілів у клітині, тканині чи організмі за певного набору умов. Отже, це ключова відмінність протеоміки від метаболоміки. Крім того, протеоміка в основному стосується повного набору білків, в той час як метаболомічні в основному стосуються повного набору метаболітів, включаючи різноманітний масив дрібних молекул, таких як пептиди, вуглеводи, ліпіди, нуклеозиди та катаболічні продукти екзогенних сполук тощо. Тому це ще одна різниця між протеомікою та метаболомікою.

Наведена нижче інфографіка підсумовує різницю між протеомікою та метаболомікою.

Підсумок - Протеоміка проти метаболоміки

Живі організми можна вивчати, використовуючи їх геном, білки та метаболіти. Геноміка, протеоміка та метаболомія - це три області, що вивчають генетичний склад, білки та метаболіти клітини чи організму відповідно. Протеоміка важлива, оскільки є динамічним відображенням як генів, так і навколишнього середовища. Метаболомія дуже важлива, оскільки безпосередньо відображає поточний стан біохімічної реакції клітин або метаболічний статус організму. Таким чином, це підсумовує різницю між протеомікою та метаболомікою.

Довідка:

1. Р, Сурат. "Як пов'язані метаболоми та протеоми?" Новини, 26 лютого 2019 р., Доступні тут.
2. Хорган, Річард Р і Луїза Кенні. "Омічні" технології огляду SAC: геноміка, транскриптоміка, протеоміка та метаболомія. " Акушерство та гінекологія, John Wiley & Sons, Ltd (10.1111), 18 липня 2011 р., Доступне тут.

Надано зображення:

1. "Протеоміка" Xxl7441 в англійських Wikibooks - Перенесено з en.wikibooks у Commons. (Публічне надбання) через Wikimedia Commons
2. «Метаболомічна схема» Lmaps (розмова) - я створив цю роботу повністю сам (CC BY-SA 3.0) через Commons Wikimedia