Різниця між протеомікою та транскриптомікою

Ключова різниця - протеоміка проти транскриптоміки
 

Технологія omic - це сучасна тенденція, коли різні біомолекули організму розглядаються як ціла колекція щодо її властивостей та функцій. Технологія omic має широкий спектр застосувань. Різні оміки біологічного зразка включають геноміку, протеоміку, транскриптоміку та метаболоміку. Протеоміка передбачає повне вивчення всіх білків у живому організмі. Він визначається як сукупність усіх експресованих білків в організмі, його структурні та функціональні властивості. Таким чином, повний набір білків утворює протеому. Транскриптоміка - це повне вивчення всіх молекул РНК (мРНК), присутніх у живому організмі. Таким чином, транскриптоміка має справу з генами, які активно експресуються в живому організмі. Загальний набір мРНК у живому організмі називається стенограмою. The ключова різниця між протеомікою та транскриптомікою базується на типі біомолекули. У протеоміці вивчається загальний набір експресованих білків у живому організмі, тоді як у стенографах вивчається загальна мРНК живого організму.

ЗМІСТ

1. Огляд та ключові відмінності
2. Що таке протеоміка
3. Що таке стенографа
4. Подібність між протеомікою та транскриптомікою
5. Поплечне порівняння - протеоміка проти транскриптоміки в табличній формі
6. Підсумок

Що таке протеоміка?

Термін "протеоміка" був введений у 1995 році і спочатку визначався як загальний білковий комплемент у клітині, тканині чи організмі. З розвитком протеомічних досліджень його потім змінили, щоб вважати парасольовим терміном, в який було включено багато дослідницьких сфер. В даний час під темою протеоміка вивчається структура, орієнтація, функції, її взаємодія, модифікації, застосування та значення білків. Тому в даний час проводиться багато досліджень у галузі протеоміки.

Перші протеомічні дослідження були зроблені для виявлення вмісту білка в Кишкова паличка. Відображення загального вмісту білка проводили за допомогою двовимірних (2D) гелів. Після успіху цього вчені перейшли до характеристики загального вмісту білка у тварин, таких як морські свинки та миші. В даний час картування білків людини проводиться за допомогою 2D гель-електрофорезу.

Застосування протеоміки

Існує багато переваг вивчення протеоміки, оскільки білки є керуючими молекулами більшої частини активності завдяки властивості каталізаторів білків. Таким чином, вивчення цілих білків може дати інформацію про стан здоров’я організму. Деякі програми є;

1. Анотація геному: Вивчаючи вміст білка в організмі, можна визначити точні геноми, відповідальні за активну білкову сполуку. У цьому сценарії важливі результати всієї геноміки, транскриптоміка та протеоміка.
2. Ідентифікація хвороби / Діагностика: Протеоміка використовується для ідентифікації стану хвороби шляхом порівняння здорових та хворих
3. Виконувати експресія білка вивчали під час експериментів.
4. Модифікація білка та дослідження взаємодії: Для того, щоб використовувати білки в vitro умови або і у природніх умовах умови, визначити умови зберігання цих екстрагованих білків та вивчити поведінку білка в в пробірці, у природніх умовах а в - силіконові методи.

Малюнок 01: Протеоміка

Існують різні методики, що беруть участь у протеоміці

1. Екстракція загального білка і розділення білків за допомогою 2D гель-електрофорезу. Білки можна також відокремити за допомогою високоефективної рідинної хроматографії (HPLC).
2. Послідовність виділених білків за допомогою таких методів, як метод секвенування Едмунда або Мас-спектрометрія.
3. Після виявлення послідовностей аналізуються структурні та функціональні властивості вмісту білка за допомогою комп'ютерного програмного забезпечення та інструментів біоінформатики.

Що таке транскриптоміка?

Термін стенограми придуманий нещодавно. Транскриптоміка - це вивчення загального вмісту мРНК в організмі. Загальна мРНК - це виражена ДНК у живому організмі чи клітині. Повна колекція мРНК називається стенограмою.

Кроки до аналізу стенограми включають:,

1. Екстракція РНК, відокремлення мРНК за допомогою колонкової гель-хроматографії з полі ДТ-кулями.
2. Проведено секвенування мРНК.

Технологія мікромасив є одним із поширених способів ідентифікації стенограми організму. Техніка мікромасивки включає зондову пластину з додатковими нитками транскрипту. Після гібридизації можна охарактеризувати наявну в організмі або клітинах мРНК.

Малюнок 02: Транскриптомічні методи

Транскриптоміка зараз широко використовується в галузі медицини. Діагностика захворювань та профілактика захворювань - основні сфери, в яких використовується Транскриптоміка. Аналізуючи стенограму організму, можна виявити чужорідну мРНК, а якщо є інфекції, її можна ідентифікувати. Некодуючу РНК можна відокремити за допомогою транскриптомних технологій. А також можна контролювати експресію генів при різних екологічних навантаженнях.

 Які подібності між протеомікою та транскриптомікою?

• Обидва є частиною концепції омічної технології.
• Обидва вони використовуються в діагностиці захворювання та характеристиці хвороби організму.
• Обидві досліджувані області передбачали вилучення біомолекул, поділ біомолекули та послідовність етапів.

Яка різниця між протеомікою та транскриптомікою?

Протеміка проти транскриптоміки
Протеоміка передбачає повне вивчення всіх білків у живому організмі.	Транскриптоміка - це повне вивчення всіх молекул РНК (мРНК), присутніх у живому організмі.
Вивчений тип біомолекули
Білки вивчаються в протеоміці.	мРНК вивчається в транскриптоміці.
Вивчені чинники
Будова, функціонування, взаємодія, модифікації та застосування білків вивчаються в протеоміці.	Структура послідовності, взаємодія із середовищем та застосуванням мРНК вивчаються в транскриптоміці.

Підсумок - Протеоміка проти транскриптоміки 

Оміки відіграють важливу роль у галузі наук про життя. Протеоміка стосується вивчення протеому, який формує повний набір білків у клітині чи організмі. Під транскриптомікою розуміється вивчення транскриптома, який представляє собою повний набір експресованої ДНК, що знаходиться у формі мРНК. Дві досліджувані області, протеоміка та транскриптоміка, були отримані після введення геноміки і в даний час широко використовуються в медичній діагностиці, а також в характеристиці та скринінгу організмів. Це різниця між протеомікою та транскриптомікою.

Завантажте PDF-файл Proteomics vs Transcriptomics

Ви можете завантажити PDF-версію цієї статті та використовувати її в офлайн-цілях відповідно до посилань. Завантажте PDF-версію тут: Різниця між Proteomics та Transcriptomics

Довідка:

1.Хорган, Річард Р і Луїза Кенні. "Омічні" технології: геноміка, транскриптоміка, протеоміка та метаболомія. " Акушер-гінеколог, Blackwell Publishing Inc, 18 липня 2011 р. Доступний тут  
2.Грейвс, Пол Р. та Тимофій А. Дж. Хейстед. "Посібник з молекулярного біолога з протеоміки". Огляди мікробіології та молекулярної біології, Американське товариство з мікробіології, березень 2002 р. Доступно тут
3.Lowe, Rohan та ін. «Технології транскриптоміки». PLoS обчислювальна біологія, Публічна бібліотека наук, травень 2017. Доступно тут  

Надано зображення:

1.'Proteomics'By Xxl7441 в англійських Wikibooks - Перенесено з en.wikibooks у Commons., (Public Domain) через Commons Wikimedia
2.'Мікромасив і послідовність потокової комірки 'Томас Шафі - Власна робота, (CC BY 4.0) через Wikimedia Commons