Різниця між RNASE A і RNASE H

Ключова різниця - RNASE A проти RNASE H
 

Рибонуклеази - нуклеази, які специфічно деградують РНК на більш дрібні одиниці. Їх можна розділити на дві категорії; ендорібонуклеази та екзорибонуклеази. Ендорібонуклеаза - це ендонуклеаза, яка може або погіршити одноланцюжкову або дволанцюжкову РНК. Він розщеплює фосфодіефірні зв’язки у полінуклеотидній ланцюзі РНК. Прикладами є RNase A, RNase III, RNase T1, RNase P і RNase H. Екзорибонуклеаза є екзонуклеазою, яка деградувала РНК, видаляючи кінцеві нуклеотиди або з 5'-кінця, або з 3'-кінця молекули РНК. Прикладами є RNase R, RNase II, RNase D і RNase PH. The ключова різниця між RNASE A і RNASE H є тим, що RNase A - це рибонуклеаза підшлункової залози, яка специфічно деградує одноланцюжкову РНК на більш дрібні компоненти, тоді як RNase H - неспецифічний фермент, який розщеплює РНК у гібриді РНК-ДНК на більш дрібні одиниці за допомогою гідролітичного механізму.

ЗМІСТ

1. Огляд та ключові відмінності
2. Що таке RNASE A
3. Що таке RNASE H
4. Подібність між RNASE A і RNASE H
5. Порівняльне порівняння - RNASE A проти RNASE H у табличній формі
6. Підсумок

Що таке RNASE A?

РНКаза А - це панкреатична рибонуклеаза, яка спеціально розщеплює парні залишки цитозину та урацилу на 3 'кінці одноланцюгової РНК. RNase H працює при більш високій концентрації солі (0,3 М або вище концентрації NaCl). Гідролітична реакція - два етапи. Він утворює 3 'фосфорильований продукт через 2', 3 'циклічний монофосфатний проміжний продукт. Хоча це специфічно для одноланцюгової РНК при більш високій концентрації солі, вона може також деградувати дволанцюжкову РНК і РНК у гібриді РНК-ДНК при більш низькій концентрації NaCl (нижче 0,3 М NaCl).

Брюс Мерріфілд вперше синтезував цей фермент. РНКаза А - дуже популярний фермент у молекулярних дослідженнях. РНК-аза підшлункової залози великої рогатої худоби є прикладом РНКази А. І це один з найжорсткіших ферментів, які використовуються в лабораторії. Цей фермент не потребує кофактора для своєї активності. Це високо термостабільний фермент. РНКаза А - це перший фермент і третій білок, для яких було виявлено правильну послідовність амінокислот. Цей фермент дуже малий із 124 амінокислотами та молекулярною масою 12600да. І він має чотири залишки гістидину (Його 12 та Його 119, які беруть участь у каталітичній реакції).

Малюнок 01: RNase A

RNase A може бути виділена кип'ятінням сирого зразка. Коли кипить, всі інші ферменти руйнуються, що залишилися РНКаза А. РНКаза А - надзвичайно стабільний фермент. Цей фермент інгібує протеїнові інгібітори рибонуклеази, важкі метали та уридин ванадатні комплекси.

Що таке RNase H?

РНКаза Н - це неспецифічний фермент рибонуклеази, який може деградувати РНК у гібриді РНК-ДНК за рахунок гідролітичної реакції. РНКаза Н розщеплює 3'-О-Р-зв'язок РНК у гібриді РНК-ДНК. Зрештою, він виробляє продукти, що закінчуються 3'OH та 5 'фосфатами. У реплікації ДНК вона відіграє ключову роль, видаляючи праймер РНК після утворення нових ланцюгів ДНК. У лабораторних умовах він специфічно деградує РНК у гібриді РНК-ДНК, але не ДНК та негібридизованій РНК. І цей фермент зазвичай використовується для руйнування шаблону РНК після формування першого комплементарного ланцюга ДНК під час синтезу кДНК.

Малюнок 02: RNase H

RNase H також використовується в аналізах захисту нуклеаз. Він також може бути включений до видалення хвоста поли А з мРНК. RNase H має здатність руйнувати некодуючу РНК всередині і зовні клітини. Іони металів необхідні як кофактори для цієї білкової активності. Для інгібування ферменту RNase H може використовуватися хелатор (EDTA).

Які подібності між RNASE A та RNASE H?

• Обидва мають білкову природу.
• Обидва - ендорібонуклеаза
• Обидва можуть погіршити РНК.
• Обидва виконують гідролітичні реакції.
• Молекулярні лабораторії використовують і те, і інше.

Яка різниця між RNASE A і RNASE H?

RNASE A проти RNASE H
RNase A - це рибонуклеаза підшлункової залози, яка спеціально розщеплює 3 'кінець парних цитозину та урацилових залишків одноланцюгової РНК при більш високій концентрації солі.	RNase H - неспецифічний фермент рибонуклеази, який може погіршити РНК у гібриді РНК-ДНК за допомогою гідролітичної реакції.
Характер розщеплення РНК
RNase A спеціально розщеплює одноланцюжкову РНК при більш високій концентрації солі.	РНКаза Н розщеплює РНК в гібриді РНК-ДНК.
Потреба ко-факторів для діяльності
RNase A не потребує кофакторів для своєї активності.	RNase H потребує іонів металів як кофакторів для своєї активності.
Інгібітори білкової активності
Білкові комплекси інгібіторів рибонуклеази, важкі метали та уридин ванадат пригнічують активність РНКази А.	Хелатор (EDTA) пригнічує активність RNase H.
Видалення праймера РНК у реплікації ДНК
RNase A не використовується для видалення праймера РНК при реплікації ДНК.	RNase H використовується для видалення праймера РНК при реплікації ДНК
Видалення шаблону ДНК в комплементарному синтезі ДНК (С-ДНК)
RNase A не використовується для видалення шаблону РНК під час комплементарного синтезу ДНК (С-ДНК).	RNase H використовується для видалення шаблону РНК під час комплементарного синтезу ДНК (С-ДНК).
Видалення полі-хвоста в мРНК, гібридизованої до Oligo (dt)
RNase A не використовується для видалення "хвоста полі-А" в мРНК, гібридизованої до оліго (dt).	RNase H використовується для видалення "хвоста полі-А" в мРНК, гібридизованої до оліго (dt)

Підсумок - RNASE A проти RNASE H

Рибонуклеази - це нуклеазні ферменти, які мають здатність розщеплювати РНК на більш дрібні одиниці. Вони бувають двох типів; ендорібонуклеази та екзорибонуклеази. Ендобонуклеаза - це ендонуклеаза, яка має здатність до деградації одноланцюгової або дволанцюгової РНК. І він розщеплює фосфодіестерну зв’язок у полінуклеотидній ланцюзі РНК. RNase A і RNase H - дві ендорібонуклеази. RNase A - це рибонуклеаза підшлункової залози, яка спеціально розщеплює парні залишки цитозину та урацилу на 3 'кінці одноланцюгової РНК при більш високій концентрації солі. РНКаза Н - неспецифічний фермент рибонуклеази, який може погіршити РНК у гібриді РНК-ДНК за допомогою гідролітичної реакції. Це різниця між RNase A і RNase H.

Завантажте PDF RNASE A проти RNASE H

Ви можете завантажити PDF-версію цієї статті та використовувати її в офлайн-цілях відповідно до примітки. Завантажте PDF-версію тут Різниця між RNASE A та RNASE H

Довідка:

1.Карутурі, Автор Амрута. "17 потрібно знати факти про RNase A." AG Blog, 22 лютого 2017. Доступний тут
2. "Рибонуклеаза". Вікіпедія, Фонд Вікімедіа, 5 січня 2018 р. Доступний тут  

Надано зображення:

1.'RNase A'By Не надано машиночитаного автора. Vossman припускав (на основі претензій щодо авторських прав)., (CC BY-SA 2.5) через Wikimedia Commons
2.'RNase H fix'By Не надано машиночитаного автора. Vossman припускав (на основі претензій щодо авторських прав)., (CC BY-SA 2.5) через Wikimedia Commons