Різниця між шРНК і siRNA

шРНК проти siRNA

Під час процесу інтерференції РНК (RNAi) експресія гена-мішені збивається з високою специфічністю та селективністю. РНК є природним процесом, і він включає малу інтерферуючу РНК (siRNA) та коротку шпильку РНК (шРНК) та двофункціональну шРНК. В даний час RNAi широко використовується як інструмент для персоналізованої терапії раку. Застосування RNAi в основному виконується з хімічно синтезованими дволанцюжковими молекулами siRNA та векторної шРНК на основі вектора. Хоча ці дві молекули мають подібні функціональні результати, вони відрізняються за своєю структурою; таким чином, молекулярні механізми дії, шляхи РНК та ефекти цих двох молекул також не відрізняються.

шРНК

shRNA - це послідовність невеликої молекули РНК, яка робить тугий поворот шпильки, який можна використовувати для заглушення експресії цільового гена під час РНК. Експресія шРНК досягається вектором, який може бути або вірусом, або бактерією, або доставкою плазмід. Вони синтезуються в ядрі клітин і транспортуються в цитоплазму для подальших процесів. Ці молекули мають схожі шляхи дозрівання мікроРНК; Таким чином, синтез мікроРНК забезпечив основу для розуміння синтезу шРНК. Або РНК-полімераза II, або III можуть транскрибувати шРНК через промотори РНК-полімерази II або III. Перевагою використання шРНК є те, що вони мають відносно низьку швидкість деградації та обороту. Недоліком є ​​те, що він потребує експресійного вектора, що може спричинити деякі проблеми безпеки.

siRNA

siRNA - це дволанцюгові молекули РНК, що складаються з довжини 20-25 пар основ. Вони використовуються для придушення генів шляхом замовчування будь-якого гена з комплементарною нуклеотидної послідовністю на шляху RNAi. Руйнування гена шляхом трансфекції siRNA часто є невдалим через минущого ефекту; особливо у швидко ділючих клітинах і придушення не тривають довше. Щоб подолати цю проблему, siRNA модифікується шляхом введення короткої структури шпильки. Ця модифікована молекула тоді відома як шРНК. shRNA повинна бути перетворена в siRNA за допомогою Dicer, щоб продовжувати свою нормальну функцію.

Яка різниця між шРНК і siRNA?

• На відміну від siRNA, шРНК має додаткову структуру шпильки. shRNA - це модифікована версія siRNA.

• шРНК вимагає експресійного вектора, тоді як siRNA не робить.

• shRNA може використовуватися для тривалого знищення, тоді як siRNA може використовуватися лише для короткочасного знищення генів.

• На відміну від генного придушення siRNA, придушення shRNA є довготривалим, і якщо він буде вставлений через відповідний вірусний вектор, він може спричинити постійний ефект заглушення гена.

• Потрібно приємніше перетворити шРНК назад в молекулу siRNA для виконання її нормальних функцій.