Важливо мати загальні знання про склад і структуру ДНК, щоб зрозуміти різницю між ДНК у верхній і нижній течії. ДНК складається з полінуклеотидних ланцюгів. Нуклеотиди - це будівельні блоки, які створюють полінуклеотидні ланцюги, і кожен нуклеотид складається з трьох компонентів: п'ятивуглецевого цукру, азотистої основи та фосфатної групи. Фосфатна група та група ОН приєднані до 5-позиційного вуглецю та 3-позиційного вуглецю молекули цукру в нуклеотиді відповідно. Нуклеотиди з'єднуються фосфодіефірними зв’язками, утвореними між 5 'фосфатною групою одного нуклеотиду та 3' ОН-групою сусіднього нуклеотиду. Якщо полінуклеотидна ланцюг має вільну 5 'фосфатну групу, вона призначається як 5' кінець; якщо вона має вільну 3 'OH-групу, вона призначається як 3' кінець. Тому ланцюги ДНК зазвичай мають 5 'і 3' кінці відповідно до кінцевих положень полінуклеотидних ланцюгів. ДНК також існує як дволанцюгова форма. Дві пасма протипаралельно один одному. Отже, ДНК має дві ланцюги, які рухаються у напрямку 5 'до 3' та 3 'до 5'. Вища і нижня течія ДНК посилається на транскрипцію та синтез ланцюга мРНК від 5 'до 3'. Якщо ДНК розглядається у напрямку до 5 кінця кодуючої ланцюга з сайту ініціації транскрипції, вона відома як ДНК вище за течією. Якщо ДНК розглядається до 3 'кінця з кодуючої ланцюга з сайту ініціації транскрипції, називається ДНК за течією. Це ключова відмінність між ДНК у верхній і нижній течії.
ЗМІСТ
1. Огляд та ключові відмінності
2. Що таке вище ДНК
3. Що таке нижча ДНК
4. Порівнювання порівняння - ДНК проти течії проти нижньої течії
5. Підсумок
Ген - це спадковість структурної та функціональної одиниці, яка розташована на ДНК організму. Він зберігається з інструкціями щодо побудови білка. Ген має специфічну область молекули ДНК. За потреби, він транскрибує та перетворює на білок за допомогою синтезу нитки мРНК. Зазвичай ланцюг кодування гена працює в напрямку від 5 'до 3'. Коли вона транскрибується, вона виробляє нитку мРНК в тому ж напрямку 5 'до 3'. Під час транскрипції антисмисловим ланцюгом 3 'до 5' подається як шаблонний ланцюг і ініціює синтез мРНК. У гені є сайт ініціації транскрипції. З посиланням на сайт ініціації транскрипції, область ДНК у напрямку до 5 'кінця ланцюга кодування відома як ДНК вище за течією. Промотор гена, як правило, розташований у верхній частині ДНК. У еукаріотичних генах є області TATA, промоторні проксимальні елементи та підсилювачі в області вище за течією гена. Верхній ділянці гена називають негативними числами. ДНК гена вище за течією має надзвичайно важливе значення для транскрипції.
Сайт ініціації транскрипції відомий як +1 точка гена. Область ДНК від точки +1 до 3 'кінця кодуючої ланцюга відома як ДНК вниз за течією. Іншими словами, низхідний потік гена знаходиться від сайту ініціації транскрипції до 5 'кінця ланцюга шаблону. Тому низхідна ДНК генової області включає транскрипційну одиницю та інші послідовності, такі як послідовність термінатора. Промотор може впливати на послідовність гена нижче за течією. Нижня частина гена посилається на позитивні числа. Нижня ДНК гена - це фактична область, яка дає білковий продукт.
Малюнок 01: ДНК вгору і вниз за течією
Вгору проти ДНК по течії | |
Область ДНК у напрямку до 5 'кінця кодуючої послідовності з сайту ініціації транскрипції відома як ДНК вище за течією. | Область ДНК у напрямку до 3 'кінця ланцюга кодування від сайту ініціації транскрипції відома як ДНК за течією. |
Елементи | |
Промотори та підсилювачі розташовані на верхній ДНК | Блок транскрипції та послідовності термінатора розташовані в нижній частині ДНК. |
Нумерація | |
Нуклеотиди у верхній течії позначаються від'ємними числами | Нуклеотиди називаються додатними числами. |
Функція | |
Цей регіон містить елементи, необхідні для регулювання та ініціювання транскрипції | Цей регіон містить інструкцію виробляти білок і припиняти транскрипцію |
Легко ідентифікувати за течією РНК та нижче за течією. Що стосується референтного сайту, то область до 5 'кінця ланцюга РНК відома як РНК вище за течією, тоді як область до кінця 3' відома як РНК нижче за течією. Однак у ДНК є дві нитки, які проходять в обох напрямках 5 'до 3' і 3 'до 5'. Отже, різниця між ДНК у верхній і нижній течії є складною. Тому він диференційований з посиланням на транскрипцію гена. Від місця ініціації транскрипції до 5 кінця сенсорної ланцюга область ДНК відома як ДНК вище за течією, тоді як від місця ініціації транскрипції до 3 'кінця сенсорної ланцюга відома як нижча ДНК. Це різниця між вищою та нижньою течією ДНК.
Список літератури:
1. Rhee, Amy C., Benjamin H. Somerlot, Neeta Parimi, and Jonatha M. Gott. "Виразні ролі для послідовностей, розташованих вище та за течією від сайтів Physarumediting." РНК. Лабораторна преса «Холодна весна», вересень, 2009. Веб. 18 березня 2017 року
Надано зображення:
1. Барбоса, Крістіна, Ізабель Пейшейро та Луїса Ромао. "Регулювання генологічної експресії шляхом відкритих кадрів для читання та захворювань людини". PLOS Генетика. Публічна бібліотека наук, н.д. Веб. 18 березня 2017 року.