Різниця між повним секвенуванням геному та секвенуванням ексом

The ключова різниця між послідовностями цілого генома і екзеквенним послідовності є те, що цілі послідовності геномних послідовностей у всьому геному організму, тоді як послідовності послідовності exome тільки гени екзома або кодують білок організму.

Послідовність - це техніка, яка визначає точний порядок нуклеотидів у певній молекулі ДНК. Це просто відображає правильний порядок чотирьох основ; аденін (A), гуанін (G), цитозин (C) і тимін (T) у фрагменті ДНК. Існує кілька методів секвенування, таких як секвенування Сангера, послідовності наступного покоління тощо. Крім того, або повний геном організму (ціле секвенування генома), або тільки гени, що кодують білок у геномі (екзеквенне секвенування) можуть зазнавати секвенування.

ЗМІСТ

1. Огляд та ключові відмінності
2. Що таке ціле секвенування геному
3. Що таке послідовне життя
4. Подібність між повним секвенуванням геному та секвенуванням ексом
5. Порівняльне порівняння - Послідовність геномів у цілому та Екзомета в табличному вигляді
6. Підсумок

Що таке секвенування геномів у цілому?

Геном людини містить майже три мільярди пар основ ДНК. Ціле послідовність геномів - це метод, який послідовно виконує повний геном організму. Таким чином, у цілому послідовності генома розглядається вся колекція молекул ДНК, включаючи доходи, інтрони, міжгенні простори тощо. Більше того, цілі послідовності генома не тільки геному, який знаходиться всередині ядра, але і ДНК мітохондрій..

Малюнок 01: Послідовність цілого геному

Готуючись до цього послідовності, перший крок - витягнути всю ДНК. Потім вилучена ДНК проходить процедуру секвенування, використовуючи відповідний метод секвенування. Аналізуючи отримані послідовності, використовуючи інструмент біоінформатики, ми можемо виявити рідкісні захворювання, рак, інфекційні захворювання тощо.

Що таке послідовне життя?

Екзоме - це частина геному, яка містить близько 1,5% геному, і це колекція екзонів. Екзони - це послідовності, які транскрибуються в мРНК, а потім у кінцевий білковий продукт. Отже, екземовані послідовності послідовності всіх послідовностей, що кодують білок, у геному. Екзоменоване послідовність виявляє генетичні порушення, оскільки більшість генетичних порушень виникають через мутації генів, що кодують білок. Отже, діагностичні процеси генетичних порушень часто використовують послідовності ексом як метод діагностики захворювання. Крім того, при порівнянні з усією заявкою на секвенування геномів для генетичного тестування, екзеквенне секвенування потребує меншого часу для використання і є дешевшим.

Малюнок 02: Послідовність результатів

У послідовності exome, по-перше, необхідно відбирати лише послідовності, що кодують білок, із загальної ДНК. Зауважимо, що люди мають близько 180000 послідовностей, що кодують білок. Потім екзему секвенують за допомогою методу секвенування з високою пропускною здатністю.

Назвіть схожість між секвенуванням геном усього і послідовністю ексом?

• Повний секвенування геномів та секвенування ексом - це дві програми послідовності.
• Обидва методи корисні для визначення правильного порядку нуклеотидної послідовності в обох методах.
• Також біоінформатика допомагає в обох методах аналізу даних.

Яка різниця між повним секвенуванням геному та секвенуванням ексом?

Цілі секвенування геному секвенують всю ДНК геному організму, в той час як послідовності екземування послідовностей лише білок, що кодує білок, з геному. Отже, це принципова відмінність між послідовностями цілого генома та послідовностями ексом. Крім того, хоча обидва способи широко використовуються для визначення правильного порядку нуклеотидної послідовності, ціле послідовність геномів є дорогим і трудомістким, ніж послідовності exome.

Інфографіка, наведена нижче, відображає різницю між послідовністю цілого геному та послідовності ексом.

Короткий зміст - Послідовність геномів у цілому та послідовне дію

Послідовність послідовностей виявляє точний порядок підстав у фрагменті ДНК, і це може бути як ціле секвенування геному, так і екзоменоване послідовності. Тут цілий геномний послідовності послідовності є повним геномом організму, тоді як послідовності екзему тільки генетично кодують послідовності в геномі. Розглядаючи їх застосування, ціле секвенування геномів є корисним для аналізу генетичних аберацій, таких як поодинокі нуклеотидні варіації, делеції, інсерції тощо у цілому геномі, тоді як послідовність ексом допомагає виявляти генетичні захворювання. Отже, це різниця між послідовностями цілого геному та екзеквенним послідовностями.

Довідка:

1. "Послідовність цілого генома проти цілодоступного послідовності проти цільових панелей секверування". Healio, SLACK Incorporated. Доступний тут  
2. "Що таке ціле секвенномереза ​​і цілі секвенування геному?" - Домашня довідка з генетики - NIH. " Національна медична бібліотека США, Національні інститути здоров'я. Доступний тут  

Надано зображення:

1. "Послідовування цільного рушничного генома проти ієрархічного послідовності рушниць" Комінс, Дж., Тофт, К., Фарес, М. А. - "Методи обчислювальної біології та їх застосування до порівняльної геноміки ендоцелюлярних симбіотичних бактерій комах". (CC BY-SA 2.5) через Wikimedia Commons  
2. "Пересічний робочий процес 1a" від SarahKusala - Власна робота, (CC BY 3.0) через Commons Wikimedia