Різниця між фазовим вектором YAC та M13

Ключова різниця - YAC проти фазового вектора M13
 

Клонування ДНК - важливий процес, який дозволяє поширювати важливі фрагменти ДНК організмів. Для створення рекомбінантної ДНК, яка трансформується в організм-хазяїн, потрібно з'єднання специфічної ДНК з векторною ДНК. Вектор - це молекула ДНК, яка веде себе як носій для перенесення чужорідного генетичного матеріалу в іншу клітину чи організм. Він повинен бути здатним до реплікації всередині організму-господаря і створювати кілька копій рекомбінантної ДНК. Існують різні види векторів, які використовуються для клонування ДНК. Дріжджова штучна хромосома (YAC) та фаговий вектор М13 є двома типами. Ключова різниця між фазовим вектором YAC та M13 полягає в тому, що YAC - це штучна хромосома, яка розмножується в клітинах дріжджів поки Фаговий вектор М13 - це одноланцюгова кругова ДНК бактеріофага М13, яка реплікується в E Coli клітини.

ЗМІСТ
1. Огляд та ключові відмінності
2. Що таке YAC
3. Що таке фаговий вектор М13
4. Поплечне порівняння - YAC та M13 Phage Vector
5. Підсумок

Що таке вектор YAC?

YAC - це штучно побудована хромосома, яка має здатність переносити великий сегмент чужорідної ДНК та реплікацію всередині клітин дріжджів. Він має центромерні, теломерні та автономно реплікаційні послідовності, необхідні для реплікації та стабільності. YAC також повинен мати селективний маркер або маркери та сайти обмеження, щоб зробити його ефективним вектором клонування. Великі послідовності від 1000 kb до 2000 kb можна вставити в YAC і перенести в дріжджі.

Малюнок 01: Вектор YAC

Що таке фаговий вектор M13?

Бактеріофаг М13 - це вірус, який заражає і розмножується в E Coli. Геном бактеріофага М13 має невеликі розміри, близько 6,7 кб. Це одноланцюгова, кругова і позитивна ДНК сенсу. Цей вірус специфічно заражає E Coli бактерії через F pilus. Після потрапляння ssDNA в бактерію вона синтезує свою комплементарну ланцюг і перетворюється на dsDNA або реплікативну форму (RF) M13. РФ може вести себе як плазміда в організмі господаря. DsDNA реплікується всередині E Coli і продукує ssDNA, що містить нові фаги. Ці нові фаги постійно вивільняються з E Coli не вбиваючи клітину господаря. Однак інфекція уповільнює ріст E Coli. dsDNA може бути екстрагована з бактеріальних клітин і використана як вектори для клонування ДНК. Вони відомі як фагові вектори M13. Ними можна легко маніпулювати і використовувати аналогічно плазмідним векторам.

Притаманна здатність зараження цих фагів M13 слугує хорошою кваліфікацією для використання в якості вектора при клонуванні генів. Розробляючи M13 у вектор, в його геном слід включити кілька елементів. Вони є геном для протеїну lac-репресора (lac I), проксимальної області оператора lac Z ген, промотор лаку та сайт множинного клонування (полілінкер). Коли dsDNA M13 використовується як вектори, вона може розглядатися як вектор плазміди. Однак використання ssDNA M13 має переваги в секвенуванні ДНК та мутагенезі, спрямованому на сайт.

Оскільки вектор фага М13 несе багаторазове місце клонування в lacZ регіону, рекомбіновані вектори можна легко ідентифікувати за допомогою синінгу / білої колонії скринінгу на агарових планшетах, що містять IPTG та X-Gal. Блакитні бляшки, що утворюються на пластинах, не містять рекомбінованих фагів. Тому фаги зі вставками можна вибирати з метою клонування.

Малюнок 02: Бактеріофаг М13

Яка різниця між YAC та M13 Phage Vector?

YAC проти фазового вектора M13
YAC - генетично сконструйована хромосома, яка має здатність переносити великий сегмент чужорідної ДНК та реплікацію всередині клітин дріжджів..	Фаговий вектор М13 - це вірусний вектор, розроблений бактеріофагом М13, який використовується для вставки чужорідної ДНК E Coli.
Призначення
YAC були розроблені для клонування великих фрагментів геномної ДНК у дріжджі.	Фагові вектори M13 використовуються для вставки чужорідної ДНК E Coli.
Вставка довжини
YAC можуть містити генетичні вставки розміром мегабази (1000 kb - 2000 kb).	Розмір вставок - близько 1500 bps.
Будівництво
YAC ДНК важко очистити неушкодженим і вимагає високої концентрації для генерування векторної системи YAC.	Це відбувається за допомогою циклічного фотосинтетичного ланцюга електронів.
Стабільність
YAC нестабільний.	Фаги M13 можна легко витягти.
Розмір
Ферменти - це більші молекули.	Фаги M13 стабільні, ніж YAC.

Підсумок - YAC проти фазового вектора M13

YAC - це штучно побудована векторна система, що використовує специфічну область дріжджової хромосоми для вставки великих сегментів генетичного матеріалу до клітин дріжджів. Фаговий вектор М13 - це векторна система, отримана з бактеріофага М 13, який використовується Е coli як організм господаря. Це основна відмінність YAC від фазового вектора M13. Обидва однаково корисні в технології рекомбінантних ДНК та клонування генів.

Довідка:
1. "Вектор". Генетики-нотатки - вектор. Н.п., н.д. Веб. 16 травня 2017. https://genetics-notes.wikispaces.com/Vector
2. "Дріжджова штучна хромосома." Вікіпедія. Фонд Вікімедіа, 21 квітня 2017. Веб. 16 травня 2017 року. .

Надано зображення:
1. "M13B" від J3D3 - Власна робота (CC BY-SA 3.0) через Wikimedia Commons