Різниця між активним сайтом та сайтом, що зв'язує

The ключова різниця між активним сайтом і сайтом, що зв'язує це активний сайт сприяє каталізу хімічної реакції, тоді як сайт зв'язування сприяє зв'язуванню ліганду з великою молекулою.

Місце зв'язування - область на білку, ДНК або РНК, до якої ліганд може зв'язуватися. Ферменти - це білки. Активний сайт - це ділянка ферменту, до якої субстрати можуть зв’язуватися, щоб пройти хімічну реакцію. Цей специфічний регіон також має сайт зв'язування разом з каталітичним сайтом. Отже, сайти зв'язування допомагають лише у зв’язуванні ліганду з великою молекулою, тоді як активні сайти сприяють як зв'язуванню ліганду з великою молекулою, тим самим піддаючи йому каталізацію хімічної реакції.

ЗМІСТ

1. Огляд та ключові відмінності
2. Що таке активний сайт
3. Що таке сайт прив'язки
4. Порівняльне порівняння - Активний сайт проти Прив’язуючий сайт у табличній формі
5. Підсумок

Що таке активний сайт?

Активний сайт - це ділянка ферменту, до якої зв'язуються субстрати хімічної реакції для того, щоб пройти каталізовану хімічну реакцію. ця область складається з двох підрегіонів як сайт зв'язування та каталітичний сайт. Сайт зв'язування містить деякі залишки, які можуть сприяти зв'язуванню субстрату (реагенти) з ферментом. Каталітичний сайт допомагає каталізувати хімічну реакцію. Більше того, ця область дуже мала в порівнянні з усім об'ємом ферменту; приблизно 10-20% всього об’єму ферменту.

Малюнок 01: Сайт зв'язування та каталітичний сайт активного сайту

Зазвичай активний сайт містить 3-4 амінокислоти. решта амінокислот ферменту бере участь у підтримці третинної структури ферменту. Що ще важливіше, активний сайт має специфічну конструкцію, яка може відповідати конкретній підкладці. Тому ці ферменти реагують лише на конкретні субстрати. Але іноді ферменти для своєї функції потребують кофактори. Основна функція активного сайту - зменшити енергію активації хімічної реакції, тим самим, збільшити швидкість реакції.

Що таке сайт прив'язки?

Місце зв'язування - це область на білку, ДНК або РНК, до якої ліганд може зв'язуватися. Там ліганд може утворювати хімічний зв’язок з цим сайтом. Ці регіони демонструють специфіку; певний ліганд зв'яжеться з певним сайтом зв'язування. Тому цей сайт є мірою типів лігандів, які можуть зв'язуватися з молекулою.

Крім того, ми часто використовуємо ці регіони для функціональної характеристики біомолекул. Наприклад, ми можемо охарактеризувати функціональність активного сайту через його прив'язуючий сайт. Більше того, у випадку з ДНК, специфічним типом сайту зв'язування є сайт зв'язування фактора транскрипції, присутній у ДНК.

Яка різниця між активним сайтом та сайтом прив’язки?

Активний сайт - це ділянка ферменту, до якої зв'язуються субстрати хімічної реакції для того, щоб пройти каталізовану хімічну реакцію, тоді як сайт зв'язування є областю білка, ДНК або РНК, до якої ліганд може зв'язуватися. Це ключова відмінність між активним сайтом та сайтом прив’язки. Крім того, активні сайти присутні у ферментах, і вони допомагають збільшити швидкість реакції певної хімічної реакції за рахунок зменшення енергетичного бар'єру активації цієї реакції. З іншого боку, місця зв'язування відповідають за зв'язування конкретного ліганду з певною молекулою.

Нижче наведена інфографіка представляє різницю між активним сайтом та сайтом прив’язки у табличній формі.

Підсумок - Активний сайт проти прив’язувального сайту

Активні сайти - це ділянки ферментів, які можуть збільшувати швидкість реакції хімічної реакції за рахунок зменшення енергетичного бар'єру активації цієї реакції. Місце зв'язування - це будь-яка область, до якої ліганд може зв'язуватися. Активний сайт також містить обов'язковий сайт. Різниця між активним сайтом та сайтами, що зв'язують, полягає в існуванні та функціональності. Отже, ключова відмінність активного сайту від сайту зв'язування полягає в тому, що активний сайт сприяє каталізу хімічної реакції, тоді як сайт зв'язування сприяє зв'язуванню ліганду з великою молекулою.

Довідка:

1. "Активний сайт". Wikipedia, Фонд Вікімедіа, 24 липня 2018 р. Доступний тут 
2. "Прив'язування сайту". Wikipedia, Фонд Вікімедіа, 28 серпня 2018. Доступний тут 

Надано зображення:

1. "Ензимна структура" Томаса Шафі - власна робота, (CC BY 4.0) через Wikimedia Commons