Різниця між сторінкою SDS та Native Page

Ключова різниця - Сторінка SDS проти Native Сторінка
 

SDS та нативної сторінки - це два типи методів електрофорезу поліакриламідного гелю, які використовуються в молекулярній біології. The ключова різниця між SDS Page і Native Page - тип використовуваного поліакриламідного гелю. У SDS Page використовується денатурирующий гель, молекули відокремлюються виходячи з їх молекулярної маси. Навпаки, у Native Page використовуються неденатураційні гелі. Тому молекули відокремлюються виходячи з їх розміру, заряду та форми.

Поліакриламідний гель-електрофорез (Сторінка) використовує гель, виготовлений полімеризацією мономерів акриламіду метилен бісакриламідом. Поліакриламід твердіший і стійкіший до жару, ніж агароз. Поліакриламідні гелі мають менший розмір пор, що дозволяє ефективно розділяти білки. Існує два основні типи налаштувань сторінки, а саме сторінка SDS та Native Page. Сторінка SDS або Поліакриламідний електрофорез натрій-додецилсульфату відокремлює білки на основі їх молекулярної маси. Денатураційні гелі використовуються в SDS Page. Native Page використовує неденатурирующіе гелі і розділяє білки залежно від їх розміру, заряду та форми (3D-конформація).

ЗМІСТ

1. Огляд та ключові відмінності
2. Що таке сторінка SDS
3. Що таке рідна сторінка
4. Подібність між сторінкою SDS та Native Page
5. Порівняльне порівняння - Сторінка SDS проти рідної сторінки у табличній формі
6. Підсумок

Що таке сторінка SDS?

SDS Page - це найпоширеніша електрофоретична методика, яка використовується для розділення білків на основі їх молекулярної маси. Гель виготовляється додаванням SDS (натрію додецилсульфату), який є миючим засобом. SDS протезує білки в мономери. SDS - це аніонний миючий засіб. Тому він додає чистий негативний заряд білкам в широкому діапазоні рН. Коли чистий негативний заряд надається молекулам білка, внаслідок зміни заряду складні структури розпадаються. Завдяки негативному заряду білки притягуються до позитивного кінця. Таким чином, молекули з меншою молекулярною масою швидше рухаються по гелевій матриці і можуть спостерігатися близько до анода, тоді як білки з більшою молекулярною масою спостерігаються ближче до лунок.

Малюнок 01: Сторінка SDS

Зв'язування SDS з ланцюгом поліпептиду пропорційне його відносній молекулярній масі. Тому молекулярну масу можна також визначити за допомогою SDS Page. Фарбування гелів Page Page SDS SDS проводиться фарбуванням бромофеноловим синім. Застосування сторінки SDS в більшій мірі діапазон, коли його можна використовувати для оцінки відносної молекулярної маси та для визначення відносної кількості білків у білковій суміші. SDS Page може також використовуватися для визначення розподілу білка в суміші білків. SDS Page також застосовується для очищення та оцінки білків. Він використовується як попередня процедура вестерн-блоттінгу та гібридизації, яка, в свою чергу, використовується для картографування та ідентифікації білків.

Що таке Native Page?

Електрофорез у рідному поліакриламідному гелі (Native Page) використовує неденатураційний гель. Тому SDS-гель або будь-який інший денатурирующий агент не додають до гелевої матриці. У Native Page розділення білків ґрунтується на заряді та розмірі білка. Тому рухливість білка залежить від заряду і розміру білка.

Заряд білка залежить від бічних ланцюгів амінокислот. Якщо бічні ланцюги негативно заряджені, білок отримає загальний негативний заряд і навпаки. Білки зберігають 3D-конформацію за рахунок складання, яке відбувається. Складання результатів від кількох типів зв’язків у білках, таких як дисульфідні зв'язки, гідрофобні взаємодії та Водневі зв’язки. Тому, якщо нативну сторінку проводити при нейтральному рН, білки будуть відокремлені відповідно до молекулярної форми білка. Тому Native Page можна використовувати як чутливу техніку для виявлення зміни заряду або конформації білка.

Основна перевага натільної сторінки полягає в тому, що білок, який використовується для аналізу сторінки, може бути відновлений у початковому стані після аналізу сторінки, оскільки білок не порушується під час процесу. Native Page - це досить висока пропускна здатність, і стабільність білка підвищується.

Малюнок 02: Рідна сторінка

Після завершення запуску гелю гель Native Page можна побачити шляхом фарбування бромофеноловим синім або будь-яким іншим відповідним фарбувальним реагентом. Застосування Native Page включає поділ кислих білків, включаючи глікопротеїни, такі як людський рекомбінантний еритропоетин, або ідентифікацію білків, наявних в альбуміні сировини великої рогатої худоби (BSA).

Які схожість між сторінкою SDS та Native Page?

• І системи SDS Page, і Native Page використовують поліакриламідний гель як матрицю гелю.
• Обидва використовуються для поділу та ідентифікації білків.
• Обидва використовують електрофоретичну рухливість для розділення сполук.
• І те й інше можна виконати вертикально або горизонтально (в основному це робиться як вертикальні налаштування сторінки, оскільки довжина запуску більше).
• Для роботи обох методик необхідний апарат електрофорезу, включаючи гелевий бак, гребінці, джерело живлення.
• Візуалізацію гелю можна здійснити фарбуванням методами в обох техніках.

Яка різниця між сторінкою SDS та Native Page?

Сторінка SDS проти рідної сторінки
Сторінка SDS або Сторінка натрію-додецилсульфату розділяє білки залежно від їх молекулярної маси, і він використовує денатурирующий гель.	Native Page використовує неденатурирующіе гелі і розділяє білки залежно від їх розміру, заряду та форми (3D-конформація).
Тип гелю
На SDS-сторінці використовується денатуруючий гель.	На рідній сторінці використовується неденатураційний гель.
Наявність СДС
SDS присутній як миючий засіб для надання негативного заряду на зразку на сторінці SDS.	SDS немає на рідній сторінці.
Основи поділу
Поділ білків залежить від молекулярної маси білка на сторінці SDS.	Поділ залежить від розміру та форми молекули білка на рідній сторінці.
Стійкість білка
Стабільність білка низька на сторінці SDS.	Стабільність білка висока на рідній сторінці.
Відновлення вихідного білка
Неможливо, оскільки це денатуровано на сторінці SDS.	Можливо на рідній сторінці.

Підсумок - Сторінка SDS проти Native Сторінка

SDS Page та Native Page - це два типи методів електрофорезу поліакриламідного гелю, які використовуються для розділення білків. Сторінку SDS обробляють миючим засобом під назвою SDS. SDS придає загальний негативний заряд білку, що призводить до денатурації білка. Тому білки розділяються виходячи з їх молекулярної маси. На противагу цьому, техніка Native Page не використовує жодного денатураційного агента. Таким чином, білки або розділяються залежно від їх розміру або форми. Це різниця між сторінкою SDS та основною сторінкою.

Довідка:

1. "Принцип та метод електрофорезу гелю поліакриламіду (SDS-PAGE)." Принцип та спосіб електрофорезу гелю поліакриламіду (SDS-PAGE) | MBL Life Sience -ASIA-. Доступний тут
2. "Гелі". Білкові лабораторії Альянсу | Біофізичні характеристики. Доступний тут  

Надано зображення:

1.'SDS-PAGE Електрофорез 'на рахунку в англійській Вікіпедії, (CC BY 3.0) через Вікісховище  
2. 'Завантажте зразок в електрофорез поліакриламідного гелю' Blaz Nemec з Любляни, Словенія (CC BY-SA 2.0) через Wikimedia Commons